RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468534.1

CCDC88A-210, Transcript of coiled-coil domain containing 88A, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC88A, Length 536 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC88A-210ENST00000468534 A0A1W2PPM1 405 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
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CCDC88A-210ENST00000468534 ACSM2BQ68CK6 577 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 C1orf94Q6P1W5 598 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCDC88A-210ENST00000468534 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 CERS5Q8N5B7 392 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCDC88A-210ENST00000468534 SERAC1Q96JX3 654 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCDC88A-210ENST00000468534 C4orf36Q96KX1 117 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 UBAC1Q9BSL1 405 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCDC88A-210ENST00000468534 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa4.55□□□□□ -1.68
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CCDC88A-210ENST00000468534 MMP27Q9H306 513 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 ASB8Q9H765 288 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 THAP1Q9NVV9 213 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 MTMR10Q9NXD2 777 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 HACD3Q9P035 362 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 ZNF229Q9UJW7 825 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 UTS2RQ9UKP6 389 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 CDH9Q9ULB4 789 aa4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.682e-7■□□□□ 9.4
CCDC88A-210ENST00000468534 ZNF541Q9H0D2 1346 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 MAGEA13PA6NCF6 341 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 A6NNC1 897 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 WASH3PC4AMC7 463 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 H3BMM5 538 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 ABCD4O14678 606 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 ITGB1BP1O14713 200 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 COCHO43405 550 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 FCMRO60667 390 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 HCN1O60741 890 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 RPP14O95059 124 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 STBD1O95210 358 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 CALM1P0DP23 149 aa4.54□□□□□ -1.68
CCDC88A-210ENST00000468534 CALM2P0DP24 149 aa4.54□□□□□ -1.68
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