RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 CLDN9O95484 217 aa22.46■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 SSR2P43308 183 aa22.46■■□□□ 1.19
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SMKR1-201ENST00000462322 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 TAS2R50P59544 299 aa22.46■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 PHEXP78562 749 aa22.46■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 ACER2Q5QJU3 275 aa22.46■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 L3MBTL4Q8NA19 623 aa22.46■■□□□ 1.19
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SMKR1-201ENST00000462322 LYRM4Q9HD34 91 aa22.46■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 DMRT3Q9NQL9 472 aa22.46■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 PCTPQ9UKL6 214 aa22.46■■□□□ 1.19
SMKR1-201ENST00000462322 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa22.46■■□□□ 1.19
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SMKR1-201ENST00000462322 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
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SMKR1-201ENST00000462322 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.45■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 SLC5A8Q8N695 610 aa22.45■■□□□ 1.18
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SMKR1-201ENST00000462322 KCMF1Q9P0J7 381 aa22.45■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 ABI3Q9P2A4 366 aa22.45■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 TBK1Q9UHD2 729 aa22.45■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 SPACA6W5XKT8 324 aa22.45■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 ESPL1Q14674 2120 aa22.45■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 OR5H15A6NDH6 313 aa22.44■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 RPS13P62277 151 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 RELNP78509 3460 aa22.44■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 NR6A1Q15406 480 aa22.44■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 OR4C11Q6IEV9 310 aa22.44■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 BEST3Q8N1M1 668 aa22.44■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM151AQ8N4L1 468 aa22.44■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 KIF2BQ8N4N8 673 aa22.44■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 OR52B6Q8NGF0 335 aa22.44■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 SUN3Q8TAQ9 357 aa22.44■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 ELP5Q8TE02 316 aa22.44■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa22.44■■□□□ 1.18
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SMKR1-201ENST00000462322 TGFBR3LH3BV60 316 aa22.43■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 GOLGA8RI6L899 631 aa22.43■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 CTNSO60931 367 aa22.43■■□□□ 1.18
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SMKR1-201ENST00000462322 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
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SMKR1-201ENST00000462322 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 TMEM216Q9P0N5 145 aa22.43■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 FBXW2Q9UKT8 454 aa22.43■■□□□ 1.18
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SMKR1-201ENST00000462322 SLAMF1Q13291 335 aa22.42■■□□□ 1.18
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SMKR1-201ENST00000462322 WDR20Q8TBZ3 569 aa22.42■■□□□ 1.18
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SMKR1-201ENST00000462322 CDCP1Q9H5V8 836 aa22.42■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 CLDN16Q9Y5I7 305 aa22.42■■□□□ 1.18
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SMKR1-201ENST00000462322 STX4Q12846 297 aa22.41■■□□□ 1.18
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SMKR1-201ENST00000462322 FAM180AQ6UWF9 173 aa22.41■■□□□ 1.18
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SMKR1-201ENST00000462322 MILR1Q7Z6M3 343 aa22.41■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 LGI4Q8N135 537 aa22.41■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 FAM26EQ8N5C1 309 aa22.41■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 B3GNT7Q8NFL0 401 aa22.41■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
SMKR1-201ENST00000462322 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP22.41■■□□□ 1.18
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