RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	HSDL2	Q6YN16	418 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	TC2N	Q8N9U0	490 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	PANX2	Q96RD6	677 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	P2RY12	Q9H244	342 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ANO10	Q9NW15	660 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	GALP	Q9UBC7	116 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	6.59	□□□□□ -1.35	1e-10	■■□□□ 12.5
HDLBP-222	ENST00000449504	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
HDLBP-222	ENST00000449504	ARID1A	O14497	2285 aa		6.59	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504		A8MXE2	369 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	NRDC	O43847	1150 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	CDH1	P12830	882 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	PAX1	P15863	534 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	TNNI3	P19429	210 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	CRYGS	P22914	178 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	IDUA	P35475	653 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	SOX18	P35713	384 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	ACVR1B	P36896	505 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC1A1	P43005	524 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	MARCKSL1	P49006	195 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	DIO3	P55073	304 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	RGS1	Q08116	209 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	ASPH	Q12797	758 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC13A2	Q13183	592 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	RCAN2	Q14206	197 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	P3H1	Q32P28	736 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	BBS12	Q6ZW61	710 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF550	Q7Z398	422 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	C17orf64	Q86WR6	236 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	LRRC25	Q8N386	305 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	NENF	Q9UMX5	172 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		6.58	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504		E5RI56	91 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	PSMD3	O43242	534 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	PSTPIP1	O43586	416 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	ZBTB14	O43829	449 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	PLAU	P00749	431 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	CYP4B1	P13584	511 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	ADRA1D	P25100	572 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	CFP	P27918	469 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	IMPA1	P29218	277 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	SLCO1A2	P46721	670 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	TBPL1	P62380	186 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	RNF4	P78317	190 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	ZBED6	P86452	979 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	CDH17	Q12864	832 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	RPS6KA1	Q15418	735 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	TERF2	Q15554	542 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC18A3	Q16572	532 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	STX1A	Q16623	288 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	DCST1	Q5T197	706 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	LIPN	Q5VXI9	398 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	VASN	Q6EMK4	673 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	LINC00523	Q86TU6	105 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	LRRC6	Q86X45	466 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	CA13	Q8N1Q1	262 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	PPM1N	Q8N819	430 aa		6.57	□□□□□ -1.36
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		6.57	□□□□□ -1.36

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