RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC188H7C350 402 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CLGNO14967 610 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 STK16O75716 305 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2J2O76002 312 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ZFAND5O76080 213 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 IFNA16P05015 189 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TPOP07202 933 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC166P0CW27 439 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CD1DP15813 335 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 GSTM2P28161 218 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PTGS2P35354 604 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PAFAH1B1P43034 410 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR143P51810 404 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 MTTPP55157 894 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 LIM2P55344 173 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 POU4F1Q01851 419 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 BMPR2Q13873 1038 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 DOC2AQ14183 400 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TGFBIQ15582 683 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 OR4D1Q15615 310 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ADPRMQ3LIE5 342 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CMPK2Q5EBM0 449 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM40Q6P9F5 258 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ABHD17CQ6PCB6 329 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CD163Q86VB7 1156 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF595Q8IYB9 648 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TCAIMQ8N3R3 496 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2L5Q8NG80 312 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 EXT2Q93063 718 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SDCCAG3Q96C92 435 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TSPAN17Q96FV3 270 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SEC16BQ96JE7 1060 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 DMRTA2Q96SC8 542 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC77Q9BR77 488 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 DPH5Q9H2P9 285 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 EHD1Q9H4M9 534 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 GRPEL1Q9HAV7 217 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 SAYSD1Q9NPB0 183 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ADAP2Q9NPF8 381 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 TXNDC16Q9P2K2 825 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 ERVK-11Q9UQG0 969 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A0G2JMM0 328 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1W2PPB8 328 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A1W2PRS3 328 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 PINLYPA6NC86 204 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 KIR3DP1A8MWS1 328 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 G3V3Y1 287 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 WWP2O00308 870 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 CYR61O00622 381 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 CTNSO60931 367 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 SH3BGRLO75368 114 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 PDE9AO76083 593 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 OR6B1O95007 311 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 STMN1P16949 149 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 TFEBP19484 476 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 CD22P20273 847 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 HPDP32754 393 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 GGT5P36269 586 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 GMPRP36959 345 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 TGM3Q08188 693 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 STX4Q12846 297 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 RCN2Q14257 317 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 PDK4Q16654 411 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 UBE3DQ7Z6J8 389 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 EID3Q8N140 333 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 PSD4Q8NDX1 1056 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 FAM57AQ8TBR7 257 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 ASB15Q8WXK1 588 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 SERINC2Q96SA4 455 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 RBBP8Q99708 897 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 CPNE1Q99829 537 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 DEFB127Q9H1M4 99 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 DEPPQ9NTK1 212 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 CD274Q9NZQ7 290 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 DAPP1Q9UN19 280 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP4-206ENST00000446904 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms