RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC14L5O43304 696 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CHP2O43745 196 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF10O60809 474 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GJB3O75712 270 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PIAS2O75928 621 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 AP2A2O94973 939 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 S1PR4O95977 384 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HRGP04196 525 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FABP3P05413 133 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CKMT1AP12532 417 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB3AP20336 220 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ADRA1BP35368 520 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GGT2P36268 569 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SCRN3Q0VDG4 424 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM132DQ14C87 1099 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 AP5B1Q2VPB7 878 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4F3Q6IEY1 312 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FRMPD2BQ6IN97 320 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR73Q6P4I2 378 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 BHLHB9Q6PI77 547 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 C19orf48Q6RUI8 117 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8N402 240 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52B6Q8NGF0 335 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CD244Q9BZW8 370 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HHATLQ9HCP6 504 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC6A14Q9UN76 642 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ASB1Q9Y576 335 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PCNTO95613 3336 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ISM1B1AKI9 464 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS44E7EML9 344 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CBX4O00257 560 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC43A1O75387 559 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ECI2O75521 394 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ANXA9O76027 345 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5F1O95221 314 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPAN12O95859 305 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LGALS2P05162 132 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GLAP06280 429 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 IQCF3P0C7M6 154 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PF4V1P10720 104 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ARSDP51689 593 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 BLVRAP53004 296 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL38P63173 70 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TSNQ15631 228 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNA10Q16322 511 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 DUSP6Q16828 381 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LY6KQ17RY6 165 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ERICH5Q6P6B1 374 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RTL4Q6ZR62 310 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 C17orf107Q6ZR85 190 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RASGRP3Q8IV61 690 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LRRC17Q8N6Y2 441 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO22Q8NEZ5 403 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.123e-13■■■■■ 45.8
RABGEF1-203ENST00000439720 CREB3L4Q8TEY5 395 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 MED28Q9H204 178 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GHITMQ9H3K2 345 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGUQ9H490 435 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SDHAF2Q9NX18 166 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF226Q9NYT6 803 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FKBP7Q9Y680 259 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GVM2 712 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM220BPB1ANY3 271 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 PPEF2O14830 753 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GMDSO60547 372 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 ABLIM3O94929 683 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 RPS17P08708 135 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TXNP10599 105 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC2A4P14672 509 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNE1P15382 129 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 LHCGRP22888 699 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 INPP1P49441 399 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFV1P49821 464 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 CLCN3P51790 818 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 IKZF1Q13422 519 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA0040Q15053 153 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 P2RY14Q15391 338 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TPGS2Q68CL5 300 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FAHD1Q6P587 224 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 TFAP2EQ6VUC0 442 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 HFE2Q6ZVN8 426 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM124AQ86V42 546 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGEF1-203ENST00000439720 GHDCQ8N2G8 530 aa8.05□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms