RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423725.5

NDUFS1-202, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NDUFS1, Length 2,631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS1-202ENST00000423725 FEN1P39748 380 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 OPRD1P41143 372 aa9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 ZNF846Q147U1 533 aa9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 OXA1LQ15070 435 aa9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 DGUOKQ16854 277 aa9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 TRIM16LQ309B1 348 aa9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 FAM129CQ86XR2 697 aa9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 MACROD1Q9BQ69 325 aa9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 ITPAQ9BY32 194 aa9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 HMG20AQ9NP66 347 aa9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 PALMDQ9NP74 551 aa9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 ATAD3AQ9NVI7 634 aa9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 CKAP5Q14008 2032 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 TRBC2A0A5B9 178 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 KRBA1A5PL33 1030 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 HEPACAM2A8MVW5 462 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 H7BY64 318 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 TLL1O43897 1013 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 DPM1O60762 260 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 ADAM23O75077 832 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 HSMCR30P0CW71 290 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 MYOGP15173 224 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.953e-7■■□□□ 11.7
NDUFS1-202ENST00000423725 POU1F1P28069 291 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 XCR1P46094 333 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 KCNC4Q03721 635 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 ST3GAL4Q11206 333 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 TP53BP2Q13625 1128 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 NUMA1Q14980 2115 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 TIGD6Q17RP2 521 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 BCL7AQ4VC05 210 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 UBE2UQ5VVX9 321 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 TMC5Q6UXY8 1006 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 CEACAM20Q6UY09 585 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 SLC9B2Q86UD5 537 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 NRSN1Q8IZ57 195 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 SVOPQ8N4V2 548 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 HORMAD2Q8N7B1 307 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 SLC38A5Q8WUX1 472 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 REPS1Q96D71 796 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 PRAP1Q96NZ9 151 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 OR51E2Q9H255 320 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 DCSTAMPQ9H295 470 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 MYNNQ9NPC7 610 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 ATG2BQ96BY7 2078 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 AIREO43918 545 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 BCHEP06276 602 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 BMPR1AP36894 532 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 CTSKP43235 329 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 RXRGP48443 463 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 CLK1P49759 484 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 LRRC74AQ0VAA2 488 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 HSPB3Q12988 150 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 ZNF234Q14588 700 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 GAB4Q2WGN9 574 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 CRB2Q5IJ48 1285 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 TRIM40Q6P9F5 258 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 OR2L2Q8NH16 312 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 OR5M11Q96RB7 305 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 SPATA9Q9BWV2 254 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 TMEM38AQ9H6F2 299 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 QPCTLQ9NXS2 382 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 OSGIN1Q9UJX0 560 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 INSL6Q9Y581 213 aa9.12□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.11□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 RFXAPO00287 272 aa9.11□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 GADD45GO95257 159 aa9.11□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 SOX14O95416 240 aa9.11□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 DNTTP04053 509 aa9.11□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 PRNPP04156 253 aa9.11□□□□□ -0.95
NDUFS1-202ENST00000423725 CDK1P06493 297 aa9.11□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms