RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 MED18Q9BUE0 208 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CXorf36Q9H7Y0 433 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OGDHLQ9ULD0 1010 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 J3KTA2 159 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAP00813 363 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OPN1SWP03999 348 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP2A7P20853 494 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RRM2P31350 389 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP12P39900 470 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HNF4AP41235 474 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CCR2P41597 374 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 METAP1P53582 386 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EPHA5P54756 1037 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IL5RAQ01344 420 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CHIT1Q13231 466 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TP53BP2Q13625 1128 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DGUOKQ16854 277 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C16orf87Q6PH81 154 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PAF1Q8N7H5 531 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NANOGP1Q8N7R0 232 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ULK4Q96C45 1275 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IGSF21Q96ID5 467 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GHITMQ9H3K2 345 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RIBC2Q9H4K1 309 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C14orf119Q9NWQ9 140 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DNMT3LQ9UJW3 386 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DOCK9Q9BZ29 2069 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RFXANKO14593 260 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LYPD3O95274 346 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NTN1O95631 604 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GASTP01350 101 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CTSLP07711 333 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ENPP1P22413 925 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CSKP41240 450 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RACK1P63244 317 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC7A9P82251 487 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SF1Q15637 639 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HECTD3Q5T447 861 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 COMMD6Q7Z4G1 85 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LAX1Q8IWV1 398 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN22Q8N7P3 220 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SOCS4Q8WXH5 440 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 COPS8Q99627 209 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP26Q9BV47 211 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TM6SF2Q9BZW4 377 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCG4Q9H172 646 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ASB8Q9H765 288 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 VPS29Q9UBQ0 182 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 A4GNTQ9UNA3 340 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNA1CQ13936 2221 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HYKKA2RU49 373 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ALX3O95076 343 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GIPRP48546 466 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SEPHS1P49903 392 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 VASPP50552 380 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CRISP1P54107 249 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LMAN2Q12907 356 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RBBP7Q16576 425 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TIGD6Q17RP2 521 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AGTRAPQ6RW13 159 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZVL8 140 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL23Q86XA0 190 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PLA2G15Q8NCC3 412 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CHST14Q8NCH0 376 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC138Q96M89 665 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RIPOR3Q96MK2 946 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SPON2Q9BUD6 331 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 JAM3Q9BX67 310 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NEK6Q9HC98 313 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD10Q9NXR5 420 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SAGE1Q9NXZ1 904 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EHD3Q9NZN3 535 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CFL2Q9Y281 166 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PRQ8 180 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM129A0AVI4 362 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 M0R3G1 203 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LRATO95237 230 aa3.45□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHA1P01876 353 aa3.45□□□□□ -1.86
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