RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACEP12821 1306 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa-1.44□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 CARMIL3Q8ND23 1372 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 TENM2Q9NT68 2774 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF850A8MQ14 1090 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 F8W8V4 182 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 LGALS9O00182 355 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 O00370 1275 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 FKBP6O75344 327 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCNKO75909 580 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 VAMP5O95183 116 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 KLHL2O95198 593 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNK5O95279 499 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNTTP04053 509 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPARCP09486 303 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 SBK2P0C263 348 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 LINC00869P0C866 280 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 P4HA1P13674 534 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 HRES1P13985 223 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 FOLR1P15328 257 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 TCN2P20062 427 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCGF2P35227 344 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 UGT1A3P35503 534 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAPPC10P48553 1259 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAF10Q12962 218 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 CDC16Q13042 620 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 ECSCRQ19T08 205 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 MICAQ29983 383 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 ODF4Q2M2E3 257 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 C14orf28Q4W4Y0 310 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 LRRC24Q50LG9 513 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM240Q5SV17 173 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 GRTP1Q5TC63 336 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1orf94Q6P1W5 598 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM220AQ7Z4H9 259 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 PARGQ86W56 976 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 FSIP1Q8NA03 581 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R35Q8TAP8 253 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 CMTM2Q8TAZ6 248 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 HM13Q8TCT9 377 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 C7orf33Q8WU49 177 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 GIMAP1Q8WWP7 306 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB40AQ8WXH6 277 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM158Q8WZ71 300 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 USP6NLQ92738 828 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAF4BQ92750 862 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 RCHY1Q96PM5 261 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF157Q96PX1 679 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMIM14Q96QK8 99 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 KCNA7Q96RP8 456 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 CNPY3Q9BT09 278 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 MIS12Q9H081 205 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 LIME1Q9H400 295 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTGES2Q9H7Z7 377 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 TIGARQ9NQ88 270 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNTG1Q9NSN8 517 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPG21Q9NZD8 308 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 NRBP1Q9UHY1 535 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 LCMT1Q9UIC8 334 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 CD207Q9UJ71 328 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 CORO2BQ9UQ03 480 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 SMC3Q9UQE7 1217 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 RNF115Q9Y4L5 304 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHLDB1Q86UU1 1377 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 STRCP1A6NGW2 1772 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 PI4KAP2A4QPH2 592 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM90A7PA6NKC0 464 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 SIGLEC16A6NMB1 481 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM90A22PA8MWA6 464 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM90A12PA8MX19 464 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 H0YL77 283 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 J3QR06 171 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 FBP2O00757 339 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 APAF1O14727 1248 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTAGE5O15320 804 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANGPTL7O43827 346 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 CAND2O75155 1236 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP1B1P05026 303 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGKV5-2P06315 115 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNNT1P13805 278 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDGFRAP16234 1089 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 NPPBP16860 134 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-172P-201ENST00000411000 FGFR2P21802 821 aa-1.46□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms