RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401029.3

CAPNS1P1-201, Transcript of calpain small subunit 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CAPNS1P1, Length 633 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SH3D21A4FU49 640 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KMOO15229 486 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 XPNPEP2O43895 674 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PCDHGA12O60330 932 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GDF9O60383 454 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MPZL2O60487 215 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CLEC3AO75596 197 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 C6orf47O95873 294 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KLK1P06870 262 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ETFAP13804 333 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 DRD2P14416 443 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 BSGP35613 385 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 VIPR2P41587 438 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CRATP43155 626 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CCR8P51685 355 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TUBA1BP68363 451 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 BNIP3Q12983 259 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CLN3Q13286 438 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 AQP6Q13520 282 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZNF846Q147U1 533 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 STARD3Q14849 445 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CLCA4Q14CN2 919 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 HEPACAMQ14CZ8 416 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC5A12Q1EHB4 618 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TMEM35AQ53FP2 167 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 COX20Q5RI15 118 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SAXO2Q658L1 398 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LAIR1Q6GTX8 287 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 REEP3Q6NUK4 255 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TUBA1AQ71U36 451 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GALNT5Q7Z7M9 940 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZNF605Q86T29 641 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LRRTM4Q86VH4 590 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 C17orf64Q86WR6 236 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GPR156Q8NFN8 814 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CNIH3Q8TBE1 160 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CHPT1Q8WUD6 406 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 APH1BQ8WW43 257 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 S100ZQ8WXG8 99 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 BADQ92934 168 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CRELD1Q96HD1 420 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FEVQ99581 238 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PIP5K1AQ99755 562 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MENTQ9BUN1 341 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SARGQ9BW04 601 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MS4A8Q9BY19 250 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 NLNQ9BYT8 704 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RMI1Q9H9A7 625 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PREBQ9HCU5 417 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FBXO8Q9NRD0 319 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KCND3Q9UK17 655 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ASF1AQ9Y294 204 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 BPTFQ12830 3046 aa8□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 OR2A25A4D2G3 310 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PRAMEF25A6NGN4 478 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PRR19A6NJB7 356 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CLCA1A8K7I4 914 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CDK2AP1O14519 115 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PDE9AO76083 593 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 DIRAS1O95057 198 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 NTRK1P04629 796 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 IL3P08700 152 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TFPTP0C1Z6 253 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 HLA-EP13747 358 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CBLP22681 906 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 EPHA2P29317 976 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RRM2P31350 389 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 OPRD1P41143 372 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 P2RY2P41231 377 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ALDH9A1P49189 494 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GALK1P51570 392 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 METAP1P53582 386 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SMIM11AP58511 58 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ERVK-21P61565 698 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PRR20EP86478 221 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PRR20CP86479 221 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PRR20DP86480 221 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PRR20BP86481 221 aa7.99□□□□□ -1.13
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PRR20AP86496 221 aa7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms