RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 IGSF8Q969P0 613 aa14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 DOHHQ9BU89 302 aa14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 ABCC6O95255 1503 aa14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 C3P01024 1663 aa14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A096LPI6 279 aa14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 PLD2O14939 933 aa14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 NPRL3Q12980 569 aa14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 PDGFRLQ15198 375 aa14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 NME4O00746 187 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 FLRT2O43155 660 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 OR2B3O76000 313 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 IL3P08700 152 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 Q6ZVL8 140 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 NEUROD4Q9HD90 331 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 RFPL2O75678 378 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 E2F1Q01094 437 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 SEC23BQ15437 767 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC29A1Q99808 456 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 DPYSL5Q9BPU6 564 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 B4GAT1O43505 415 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 RP2O75695 350 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 HCKP08631 526 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 ITGA5P08648 1049 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 KCNC4Q03721 635 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 GK3PQ14409 553 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 ATG9BQ674R7 924 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 MSLNLQ96KJ4 702 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 RNF121Q9H920 327 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 CLCA1A8K7I4 914 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 OAS1P00973 400 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 F8A1P23610 371 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 HNF1BP35680 557 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 C1orf94Q6P1W5 598 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM17Q86X19 198 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 CLECL1Q8IZS7 167 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 C7orf34Q96L11 122 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 NELL2Q99435 816 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 TAS2R3Q9NYW6 316 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 UBQLN2Q9UHD9 624 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 LAMP5Q9UJQ1 280 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 ERVK-11Q9UQG0 969 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM150CB9EJG8 249 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 GSTT2P0CG29 244 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 GADD45AP24522 165 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 RGS19P49795 217 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 KLBQ86Z14 1044 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 OSTF1Q92882 214 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 PIP5K1AQ99755 562 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 WDR45Q9Y484 360 aa14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A0U1RQS6 177 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 A8MU76 341 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 KMOO15229 486 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 CYB5AP00167 134 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 ETV3P41162 512 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 PON2Q15165 354 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 PYHIN1Q6K0P9 492 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 KBTBD6Q86V97 674 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 HS3ST5Q8IZT8 346 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 FCAMRQ8WWV6 532 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 PCYT2Q99447 389 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 IL20RAQ9UHF4 553 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 GJB5O95377 273 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 SRCP12931 536 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 OPRL1P41146 370 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 STK19P49842 368 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 GTDC1Q4AE62 458 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.66□□□□□ -0.06
PTGFRN-201ENST00000393203 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms