RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 HMGA2P52926 109 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP17.96■□□□□ 0.472e-7■■■□□ 15.5
CITED2-201ENST00000367651 SYTL3Q4VX76 610 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 MPPE1Q53F39 396 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CRB2Q5IJ48 1285 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TPGS2Q68CL5 300 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 FRMPD2BQ6IN97 320 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 PIK3R3Q92569 461 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 ASPNQ9BXN1 380 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TMEM38AQ9H6F2 299 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 ENPP4Q9Y6X5 453 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 SEMA7AO75326 666 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 SOX14O95416 240 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TGFB1P01137 390 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 APOA1P02647 267 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 ITGA2P17301 1181 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 BAK1Q16611 211 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 GATAD2AQ86YP4 633 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 LAX1Q8IWV1 398 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 CEP19Q96LK0 163 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP17.96■□□□□ 0.47
CITED2-201ENST00000367651 KPNA5O15131 536 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 HOXA2O43364 376 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 GABRR2P28476 465 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 SOAT1P35610 550 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 RPS26P62854 115 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 RBBP4Q09028 425 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 PDE7AQ13946 482 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 ZNF79Q15937 498 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 MED27Q6P2C8 311 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 PAQR6Q6TCH4 344 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 OXR1Q8N573 874 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 SLC6A18Q96N87 628 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 CCDC32Q9BV29 185 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 SLC25A19Q9HC21 320 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 CLN6Q9NWW5 311 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 ZNF221Q9UK13 617 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 A0A075B6Q4 140 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 RGS5O15539 181 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 GPR37L1O60883 481 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 CSO75390 466 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 SLITRK5O94991 958 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 SEMA3DO95025 777 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 ARAFP10398 606 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 EPHB3P54753 998 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 TAS2R50P59544 299 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 C2orf80Q0P641 193 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 GPR50Q13585 617 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 STARD3Q14849 445 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 SEC23BQ15437 767 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 HTR3DQ70Z44 454 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 CPXM2Q8N436 756 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 C16orf78Q8WTQ4 265 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 PPCDCQ96CD2 204 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 REV1Q9UBZ9 1251 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 DSPPQ9NZW4 1301 aa17.95■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 SH3D21A4FU49 640 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 PDZK1P1A8MUH7 402 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 IDH3BO43837 385 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 POP4O95707 220 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 TBPL1P62380 186 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 PCDH1Q08174 1060 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 MPP7Q5T2T1 576 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 ZNF480Q8WV37 535 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 TMEM159Q96B96 161 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 WDR70Q9NW82 654 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 TRAPPC4Q9Y296 219 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 CATP04040 527 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 SOD2P04179 222 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 SCG5P05408 212 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 KRT8P05787 483 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa17.94■□□□□ 0.46
CITED2-201ENST00000367651 GDPD4Q6W3E5 623 aa17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms