RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365488.1

RNU6-652P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 652, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-652P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-652P-201ENST00000365488 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 GTF3C4Q9UKN8 822 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SATB2Q9UPW6 733 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RNF24Q9Y225 148 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 FBXO7Q9Y3I1 522 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CPQQ9Y646 472 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 AUP1Q9Y679 476 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CACNG2Q9Y698 323 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SELENOKQ9Y6D0 94 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 FRMPD3Q5JV73 1810 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PARD3Q8TEW0 1356 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 A0A096LNJ9 63 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 A0A0U1RQS6 177 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SH3PXD2BA1X283 911 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 OR5H15A6NDH6 313 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TRIM49BA6NDI0 452 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PGPEP1LA6NFU8 196 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ANKDD1BA6NHY2 528 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 LRRC72A6NJI9 287 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TTC36A6NLP5 189 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 COLCA2A8K830 154 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 FAM166BA8MTA8 275 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 A8MVM7 634 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ZNF487B1APH4 448 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PTGES3LE9PB15 166 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 H0YIG0 161 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SLC1A7O00341 560 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SLC17A2O00624 439 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 AP3D1O14617 1153 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TNFSF11O14788 317 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 NPHP1O15259 732 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 AP5Z1O43299 807 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 EMC8O43402 210 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ADAM20O43506 726 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SNX3O60493 162 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 B4GALT2O60909 372 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 NME6O75414 186 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RHBDL1O75783 438 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SERF1AO75920 110 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 STBD1O95210 358 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 FGF19O95750 216 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TBX18O95935 607 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ACTL6AO96019 429 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 IGKV1-17P01599 117 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RB1P06400 928 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ADRB2P07550 413 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CLTBP09497 229 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SBK2P0C263 348 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 P0C880 135 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PRKAR1AP10644 381 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 GOT1P17174 413 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TBPP20226 339 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 GLRA1P23415 457 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 IGFBP5P24593 272 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PSMB4P28070 264 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 OR1D2P34982 312 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SPRP35270 261 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PSMB10P40306 273 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RXRGP48443 463 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 NRIP1P48552 1158 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RPL34P49207 117 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 POU3F4P49335 361 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 FHITP49789 147 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ASCL1P50553 236 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 NDST1P52848 882 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 DIO3P55073 304 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MFAP3P55082 362 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 MFAP4P55083 255 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 UCP2P55851 309 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CLDN17P56750 224 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PTENP60484 403 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PFN3P60673 137 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RPL27P61353 136 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 DCAF7P61962 342 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 PAX5Q02548 391 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 LRRC63Q05C16 580 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 RBPJQ06330 500 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 CACNG1Q06432 222 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 ACSM1Q08AH1 577 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-652P-201ENST00000365488 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms