RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 PEX12O00623 359 aa25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 SH2D4BQ5SQS7 431 aa25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 KANK2Q63ZY3 851 aa25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ATG16L1Q676U5 607 aa25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 CYP20A1Q6UW02 462 aa25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 PLPP5Q8NEB5 264 aa25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 CHTF18Q8WVB6 975 aa25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 METTL21AQ8WXB1 218 aa25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ACPTQ9BZG2 426 aa25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 VN1R1Q9GZP7 353 aa25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 LANCL2Q9NS86 450 aa25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 BLACEA4D250 179 aa25.22■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 SLC28A1O00337 649 aa25.22■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 CLDN4O14493 209 aa25.22■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ARRB2P32121 409 aa25.22■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 PPP2R2AP63151 447 aa25.22■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 IMPG1Q17R60 797 aa25.22■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 SCIMPQ6UWF3 145 aa25.22■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa25.22■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 PHF11Q9UIL8 331 aa25.22■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 A0A0A6YYD5 115 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ARHGAP10A1A4S6 786 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ITM2AO43736 263 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 B4GALT2O60909 372 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ALOX12BO75342 701 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 EEDO75530 441 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ITGB2P05107 769 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 KLK1P06870 262 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 DEFB109BQ30KR1 87 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 UGT3A2Q3SY77 523 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 SPIN4Q56A73 249 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 HSP90B2PQ58FF3 399 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 CES4AQ5XG92 561 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 FAM219BQ5XKK7 198 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 COMMD6Q7Z4G1 85 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 GPR180Q86V85 440 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM151BQ8IW70 566 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ZNF595Q8IYB9 648 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 SHISA5Q8N114 240 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 CRELD1Q96HD1 420 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 MANSC1Q9H8J5 431 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 PFDN4Q9NQP4 134 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 FIS1Q9Y3D6 152 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 RAP2CQ9Y3L5 183 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 MED13Q9UHV7 2174 aa25.21■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 CROCCQ5TZA2 2017 aa25.2■■□□□ 1.63
CRIP1-201ENST00000330233 FAM227AF5H4B4 570 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 CYR61O00622 381 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 PRMT3O60678 531 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 FAM58BPP0C7Q3 252 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 CHN1P15882 459 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 CPN2P22792 545 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 HMGCS1Q01581 520 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 SPDYAQ5MJ70 313 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM205Q6UW68 189 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 ATG14Q6ZNE5 492 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 QSOX2Q6ZRP7 698 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 MRGPREQ86SM8 312 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 CCT7Q99832 543 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 RBCK1Q9BYM8 510 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 THAP1Q9NVV9 213 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 P4HTMQ9NXG6 502 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 FBXW2Q9UKT8 454 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 MMACHCQ9Y4U1 282 aa25.2■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 SOCS6O14544 535 aa25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 RGS14O43566 566 aa25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 GUCY1B2O75343 617 aa25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 C8orf89P0DMQ9 161 aa25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 RRADP55042 308 aa25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 HSD17B7P56937 341 aa25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 RHAGQ02094 409 aa25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 ACSM2AQ08AH3 577 aa25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 BST1Q10588 318 aa25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 ACSM2BQ68CK6 577 aa25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 KIRREL2Q6UWL6 708 aa25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 C7orf57Q8NEG2 295 aa25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 PTCHD1Q96NR3 888 aa25.19■■□□□ 1.62
CRIP1-201ENST00000330233 PRDM9Q9NQV7 894 aa25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms