RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 SLAMF1Q13291 335 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 BBS10Q8TAM1 723 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 APIPQ96GX9 242 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 PIP5K1AQ99755 562 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SLC22A4Q9H015 551 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 GJD2Q9UKL4 321 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 WASH4PA8MWX3 477 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ETFAP13804 333 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CD72P21854 359 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 BMPR1AP36894 532 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CD47Q08722 323 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 C1orf61Q13536 156 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SLC36A3Q495N2 470 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ARHGAP40Q5TG30 622 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 GOLM1Q8NBJ4 401 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 GPR26Q8NDV2 337 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 COQ8BQ96D53 544 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 OR51I1Q9H343 314 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ITGA10O75578 1167 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 HPRP00739 348 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 GGT1P19440 569 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 RGRP47804 291 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ADAM8P78325 824 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 OR13J1Q8NGT2 312 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 RHBDF1Q96CC6 855 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 MYRFLQ96LU7 910 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 KNL1Q8NG31 2342 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 MYH3P11055 1940 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 E7EQ34 232 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 C7P10643 843 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 HSF2Q03933 536 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 FAM214AQ32MH5 1076 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 PAMR1Q6UXH9 720 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SLC29A4Q7RTT9 530 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ASPGQ86U10 573 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 AVL9Q8NBF6 648 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 DOK4Q8TEW6 326 aa9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 GRIA2P42262 883 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SLC22A16Q86VW1 577 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SCML4Q8N228 414 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 OR51G2Q8NGK0 314 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 TM9SF2Q99805 663 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 IL21RQ9HBE5 538 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 MAP3K8P41279 467 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SMCO1Q147U7 214 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 TAZQ16635 292 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 WSCD2Q2TBF2 565 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SLC36A4Q6YBV0 504 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 31.9
TMOD3-201ENST00000308580 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ARL6IP5O75915 188 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.894e-9■■■■■ 60.7
TMOD3-201ENST00000308580 KCNC1P48547 511 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 NPRL3Q12980 569 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CES4AQ5XG92 561 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 MBD2Q9UBB5 411 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 UBR2Q8IWV8 1755 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 DENRO43583 198 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 CKMT1AP12532 417 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 HLCSP50747 726 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ARF5P84085 180 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 ZXDBP98169 803 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 EPYCQ99645 322 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 TTTY10Q9BZA0 68 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 FZD3Q9NPG1 666 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 NLGN3Q9NZ94 848 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 VILLO15195 856 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 LATO43561 262 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 RUNX3Q13761 415 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 TMEM236Q5W0B7 351 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.5□□□□□ -0.89
TMOD3-201ENST00000308580 COMMD6Q7Z4G1 85 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms