RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ASPDHA6ND91 283 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 POM121BA6NF01 834 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 D6RAR5 112 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NPIPB8E9PQR5 432 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 EI24O14681 340 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TAPBPO15533 448 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 AQP9O43315 295 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 BNIP3LO60238 219 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NUAK1O60285 661 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 UGDHO60701 494 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SEMA7AO75326 666 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OR6B1O95007 311 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN7O95471 211 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GUCA1CO95843 209 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FTH1P02794 183 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ALPIP09923 528 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 THRBP10828 461 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HSD3B1P14060 373 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ETS2P15036 469 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GNLYP22749 145 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PRPH2P23942 346 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HSD3B2P26439 372 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 IL12AP29459 219 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GGT5P36269 586 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NNMTP40261 264 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HTR6P50406 440 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN8P56748 225 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4D2P58180 307 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ABHD18Q0P651 414 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 IL18R1Q13478 541 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf61Q13536 156 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF284Q2VY69 593 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RUNDC3AQ59EK9 446 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ERICH5Q6P6B1 374 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 DLEU7Q6UYE1 221 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RIMKLAQ8IXN7 391 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MICU2Q8IYU8 434 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LIX1Q8N485 282 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SETD9Q8NE22 299 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OR5K1Q8NHB7 308 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SSC4DQ8WTU2 575 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SELENOMQ8WWX9 145 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 USP7Q93009 1102 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NCLNQ969V3 563 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC47A1Q96FL8 570 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PPM1MQ96MI6 270 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FOPNLQ96NB1 174 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM74Q96NL1 305 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52E6Q96RD3 313 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 BOCQ9BWV1 1114 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 STRADBQ9C0K7 418 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 IL26Q9NPH9 171 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ARL15Q9NXU5 204 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ETAA1Q9NY74 926 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 USE1Q9NZ43 259 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ADGRE2Q9UHX3 823 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HRH3Q9Y5N1 445 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PDZD2O15018 2839 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 AGAP14A8MT82 685 aa6.73□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 IQCF5A8MTL0 148 aa6.73□□□□□ -1.33
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