RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 OXR1Q8N573 874 aa14.27□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 FAM46DQ8NEK8 389 aa14.27□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.27□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 FZD3Q9NPG1 666 aa14.27□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CLEC2DQ9UHP7 191 aa14.27□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 DSPPQ9NZW4 1301 aa14.27□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TRBC2A0A5B9 178 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CSO75390 466 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SLC16A8O95907 504 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CXCR2P25025 360 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 IMPA1P29218 277 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 DDOSTP39656 456 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ZFP69Q49AA0 526 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 KRT73Q86Y46 540 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RAB43Q86YS6 212 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 C11orf16Q9NQ32 467 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RAB23Q9ULC3 237 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ARRDC5A6NEK1 342 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 FADS2P1A8MWK0 482 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 GPR37L1O60883 481 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 OLFM2O95897 454 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 FURINP09958 794 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RHCEP18577 417 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CRYBB2P43320 205 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TGM4P49221 684 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PRSS53Q2L4Q9 553 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 C22orf39Q6P5X5 142 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 OR56A3Q8NH54 315 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 FIBINQ8TAL6 211 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 NEIL2Q969S2 332 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 DMRTB1Q96MA1 342 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PKP4Q99569 1192 aa14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TLR4O00206 839 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 FFAR1O14842 300 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 IFNA14P01570 189 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ARAFP10398 606 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SELPP16109 830 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PREPP48147 710 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RORCP51449 518 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PSPHP78330 225 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 DUSP7Q16829 419 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 MED27Q6P2C8 311 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SRRQ9GZT4 340 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SNTG1Q9NSN8 517 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CENPXA8MT69 81 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 NPC1O15118 1278 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 GUCY1B2O75343 617 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 IL7P13232 177 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 FEN1P39748 380 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 LIM2P55344 173 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PDE7AQ13946 482 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 CDK10Q15131 360 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SLC34A3Q8N130 599 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PPCDCQ96CD2 204 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 WDFY2Q96P53 400 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PHOX2BQ99453 314 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 REV1Q9UBZ9 1251 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 KCND3Q9UK17 655 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 ANGPT4Q9Y264 503 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 PCM1Q15154 2024 aa14.25□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 MEIOCA2RUB1 952 aa14.24□□□□□ -0.13
SYP-201ENST00000263233 SLC35F4A4IF30 521 aa14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms