RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249499.7

HOXD9-201, Transcript of homeobox D9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD9, Length 1,870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD9-201ENST00000249499 SAXO2Q658L1 398 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 RNF130Q86XS8 419 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 ZFAND2BQ8WV99 257 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 BMFQ96LC9 184 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 SLC6A20Q9NP91 592 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 PTTG2Q9NZH5 202 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 SNX7Q9UNH6 387 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.78■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 C10orf142B7Z368 130 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 TMPRSS11DO60235 418 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 FOSL2P15408 326 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 TTKP33981 857 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 SOAT1P35610 550 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 MANFP55145 182 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 PLCL1Q15111 1095 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 KDM4DQ6B0I6 523 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 SLC30A9Q6PML9 568 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM92Q6UXU6 159 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 SLC44A3Q8N4M1 653 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 PDXPQ96GD0 296 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 TPD52L3Q96J77 140 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF347Q96SE7 839 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 FAIM2Q9BWQ8 316 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 CXorf36Q9H7Y0 433 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 ZSCAN32Q9NX65 697 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 U3KQV3 271 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 TMEM229AB2RXF0 380 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 hCG_2039718K7EN88 272 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 UGT2B11O75310 529 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 GUCY1B2O75343 617 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 IGFBP5P24593 272 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 AKT2P31751 481 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 ACSL1P33121 698 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 RYKP34925 604 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 BCL6P41182 706 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 SSR2P43308 183 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 CLDN2P57739 230 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF425Q6IV72 752 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 GALNT10Q86SR1 603 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 AMIGO1Q86WK6 493 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 MMP21Q8N119 569 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 PIK3C3Q8NEB9 887 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 SLC22A18Q96BI1 424 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 KCNK12Q9HB15 430 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 VCX3AQ9NNX9 186 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 TBC1D29Q9UFV1 150 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 CEPT1Q9Y6K0 416 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa21.77■■□□□ 1.08
HOXD9-201ENST00000249499 C2CD4DB7Z1M9 353 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 C9P02748 559 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 MAGEA8P43361 318 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 CDH15P55291 814 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 DSTNP60981 165 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 IFI44LQ53G44 452 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 MFSD9Q8NBP5 474 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 TWSG1Q9GZX9 223 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 THSD1Q9NS62 852 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 ACSL6Q9UKU0 697 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 F5P12259 2224 aa21.76■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 ADAMDEC1O15204 470 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 JRKO75564 520 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 ITGA2P17301 1181 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 PRKACGP22612 351 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 CCINQ13939 588 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 LRRC32Q14392 662 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF691Q5VV52 312 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 CEP68Q76N32 757 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 NFKBIDQ8NI38 313 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 KCNC2Q96PR1 638 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 DPH7Q9BTV6 452 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 SLAMF7Q9NQ25 335 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 KLF15Q9UIH9 416 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 BLOC1S6Q9UL45 172 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 ATG2BQ96BY7 2078 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 MYO1GB0I1T2 1018 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 PIGAP37287 484 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 ALDH9A1P49189 494 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 KEAP1Q14145 624 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 SLC9A5Q14940 896 aa21.75■■□□□ 1.07
HOXD9-201ENST00000249499 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms