RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccnb2P30276 398 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nat3P50296 290 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hoxd13P70217 339 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam105aQ3TVP5 353 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 C2cd4cC2CD4Q5HZI2 419 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Med26Q7TN02 588 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp2r1bQ7TNP2 601 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr320Q7TRZ4 306 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gjc2Q8BQU6 440 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TtpaQ8BWP5 278 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bbs4Q8C1Z7 520 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lancl3Q8CD19 420 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fndc5Q8K4Z2 209 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gbgt1Q8VI38 347 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Acsm1Q91VA0 573 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pcdhga11Q91XY8 933 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Aar2Q9D2V5 384 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atp5dQ9D3D9 168 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 1700086D15RikQ9D9E9 151 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PrepQ9QUR6 710 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eif4hQ9WUK2 248 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Spats1A2RRY8 269 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sypl1O09117 261 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Abcb1aP21447 1276 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rin3P59729 980 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ptpn2Q06180 406 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sox4Q06831 440 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pyroxd2Q3U4I7 581 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Aifm2Q8BUE4 373 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 BtdQ8CIF4 520 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Foxe1Q8R2I0 371 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Q99LU8 229 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NwcQ9CQI4 244 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ankrd7Q9D504 279 aa20.97■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tdrd6P61407 2134 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tnfrsf25B1AWN9 411 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 GfapP03995 430 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hsf2P38533 535 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Myadml2Q08AU7 307 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ulk3Q3U3Q1 472 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 BC061212Q6P8K3 481 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cnksr3Q8BMA3 555 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dpep2Q8C255 478 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pdlim5Q8CI51 591 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ddx52Q8K301 598 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NotumQ8R116 503 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr1033Q8VFK5 310 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 As3mtQ91WU5 376 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NepnQ9CQ76 512 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Naalad2Q9CZR2 740 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 RtcAQ9D7H3 366 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NaaaQ9D7V9 362 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PalmdQ9JHU2 551 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PnckQ9QYK9 343 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm7275E9Q1B3 247 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm21897J3KMP5 500 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn2r111K7N674 857 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm21750L7N228 499 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PdxpP60487 292 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tgm3Q08189 693 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rars2Q3U186 578 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 CrxosQ3UL53 246 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Armc5Q5EBP3 926 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Xkr5Q5GH66 676 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zscan26Q5RJ54 466 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Amer3Q6NS69 780 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prrg3Q6PAQ9 231 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Palm2Q8BR92 376 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem72Q8C3K5 275 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 EndovQ8C9A2 338 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 SynpoQ8CC35 929 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cdt1Q8R4E9 557 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lims1Q99JW4 325 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 4930553M12RikQ9CUH1 165 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2310003L06RikQ9CV82 495 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 5530401A14RikQ9D3H9 131 aa20.96■□□□□ 0.95
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mybpc1D3YU50 1127 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ap1arE9PYF7 298 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn2r56E9Q4U5 779 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Scamp3O35609 349 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pabpc1P29341 636 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ceacam1P31809 521 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Efna1P52793 205 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stard6P59096 233 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cds1P98191 461 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zfp935Q14DI0 353 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr765Q7TRI6 309 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc7a6Q8BGK6 515 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Efemp1Q8BPB5 493 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 UstQ8BUB6 407 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slitrk6Q8C110 840 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr767Q8VG33 309 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr541Q8VGM0 312 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Acsl6Q91WC3 697 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atg13Q91YI1 516 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ceacam2Q925P2 520 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krt81Q9ERE2 481 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 IL36RNQ9QYY1 156 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DstnQ9R0P5 165 aa20.95■□□□□ 0.94
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Loxl3Q9Z175 754 aa20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 46.1 ms