RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001872.4

Hoxd13-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd13, Length 2,483 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pex5lQ8C437 567 aa18.96■□□□□ 0.63
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cnot2Q8C5L3 540 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Olfr1346Q8VGH6 313 aa18.96■□□□□ 0.63
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Use1Q9CQ56 270 aa18.96■□□□□ 0.63
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Prl8a9Q9CQ58 241 aa18.96■□□□□ 0.63
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kdm8Q9CXT6 414 aa18.96■□□□□ 0.63
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zfp626A0A0U1RQ84 676 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmem236A2ARJ3 344 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Btnl6A2CG22 539 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Btnl4A2CG29 586 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm436B1AVU6 407 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Slc6a2O55192 617 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Il1rnP25085 178 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arf5P84084 180 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ccdc61Q3UJV1 511 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nfe2l2Q60795 597 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 RhocQ62159 193 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 TCAIMQ66JZ4 499 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Med26Q7TN02 588 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Q80Y39 304 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nlgn3Q8BYM5 825 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Samd3Q8C4H2 520 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Chchd4Q8VEA4 139 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tnfrsf12aQ9CR75 129 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 5530400C23RikQ9D3I0 173 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Epm2aQ9WUA5 330 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vwa8Q8CC88 1905 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nlrp1bA1Z198 1177 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm13088A2AGW6 460 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Crisp4E9PVG4 293 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm5861F6VCN9 180 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 4933402N22RikF7D1B3 190 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lsm2O35900 95 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 P01679 107 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Arpp19P56212 112 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Nanos3P60324 178 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fbxl3Q8C4V4 428 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vmn1r191Q8K4D0 298 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Mapre2Q8R001 326 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vmn1r18Q8R2C8 299 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 McatQ8R3F5 381 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Lrch4Q921G6 680 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Uqcc2Q9CQY6 136 aa18.95■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sppl2cA2A6C4 690 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 H2al1oL7MU04 110 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cyp4a10O88833 509 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Csn1s1P19228 313 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 DctP29812 517 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Kcnj5P48545 419 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ripk1Q60855 656 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zswim7Q9CWQ2 152 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Creb3l4Q9D2A5 370 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 5530401A14RikQ9D3H9 131 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vmn1r29Q9EQ41 303 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Col24a1Q30D77 1733 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Otud4B2RRE7 1107 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Trim12cD3Z3L3 497 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm7945F6QI24 236 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm20503G3UZK1 150 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm5152L7N200 190 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Atoh1P48985 351 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tekt4Q149S1 447 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Uimc1Q5U5Q9 727 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Cramp1Q6PG95 1285 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tas2r13Q7M720 305 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Pomt2Q8BGQ4 820 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 TrhdeQ8K093 1025 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Unc5aQ8K1S4 898 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fam83aQ8K2P2 436 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 FlcnQ8QZS3 579 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Olfr1208Q8VG47 308 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Olfr668Q8VGW3 318 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Olfr1352Q8VGX5 309 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vmn1r51Q8VIC6 319 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Eef1e1Q9D1M4 174 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Fhl5Q9WTX7 284 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Sema4gQ9WUH7 837 aa18.94■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vmn1r9A2RST7 299 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Olfr172E9Q8F6 309 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 5830473C10RikF8VQ07 620 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm3476K7N6V0 257 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vmn2r112L7N221 857 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm6401L7N2C0 213 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Prdx3P20108 257 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 MedagQ14BA6 303 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gm45902Q3UDN3 361 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 B020004J07RikQ3UTC0 476 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gdi2Q61598 445 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Avpr1aQ62463 423 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tas2r3Q7TQA7 316 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Metap1Q8BP48 386 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Ptges2Q8BWM0 384 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Gpat3Q8C0N2 438 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Tmem200aQ8C817 491 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Abi1Q8CBW3 481 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Zbtb9Q8CDC7 459 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Rbm47Q91WT8 590 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Btnl10Q9JK39 275 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Bloc1s6Q9R0C0 172 aa18.93■□□□□ 0.62
Hoxd13-201ENSMUST00000001872 Vmn1r10W4VSP8 311 aa18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.6 ms