RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620944.4

NME4-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NME4, Length 1,193 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-211ENST00000620944 F2RL3Q96RI0 385 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 PAFAH2Q99487 392 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 ROGDIQ9GZN7 287 aa20.39■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 DOCK10Q96BY6 2186 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 SAGE2PA6NJ88 616 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 A8MUA0 341 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 KRT38O76015 456 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 RASAL1O95294 804 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 EDN3P14138 238 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 CERS1P27544 350 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 SERPINB1P30740 379 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 CASP2P42575 452 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 RUNX2Q13950 521 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 ABHD17CQ6PCB6 329 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 CHSY3Q70JA7 882 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 NECTIN3Q9NQS3 549 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 SHANK1Q9Y566 2161 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 HSD17B7P56937 341 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 SETDB1Q15047 1291 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 TMEM35AQ53FP2 167 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 ZNF766Q5HY98 468 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 ZNF595Q8IYB9 648 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 HORMAD2Q8N7B1 307 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 QRFPRQ96P65 431 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 CENPKQ9BS16 269 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 FUT8Q9BYC5 575 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 ACTR8Q9H981 624 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 ANKRD10Q9NXR5 420 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 SPACA6W5XKT8 324 aa20.37■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 GABRR3A8MPY1 467 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 SH3BGRLO75368 114 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 MYO1DO94832 1006 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 CRYABP02511 175 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 MTHFD2P13995 350 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 PIK3CGP48736 1102 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 LIM2P55344 173 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 PHEXP78562 749 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 TUBA3CQ13748 450 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 AP5B1Q2VPB7 878 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 GRHL2Q6ISB3 625 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 TUBA3EQ6PEY2 450 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 IFT20Q8IY31 132 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 LAS2Q8IYD9 372 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 LGI4Q8N135 537 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 KIF2BQ8N4N8 673 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 OR7G3Q8NG95 312 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 ELP5Q8TE02 316 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 SCYL1Q96KG9 808 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 C5orf34Q96MH7 638 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 TBCDQ9BTW9 1192 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 DEFB126Q9BYW3 111 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 CDCP1Q9H5V8 836 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 ADGRE2Q9UHX3 823 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 DAPP1Q9UN19 280 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 SLC5A6Q9Y289 635 aa20.36■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 DDAH2O95865 285 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 TGFB1P01137 390 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 RBP1P09455 135 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 GP1BBP13224 206 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 CNTFP26441 200 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 ECHS1P30084 290 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 SSR2P43308 183 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 RAP1GDS1P52306 607 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 OR1C1Q15619 314 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 CLNKQ7Z7G1 428 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 REPS1Q96D71 796 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 CMTM7Q96FZ5 175 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 SLX1AQ9BQ83 275 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 MS4A8Q9BY19 250 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 NFU1Q9UMS0 254 aa20.35■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 COL12A1Q99715 3063 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 E2F3O00716 465 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 IFNA16P05015 189 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 CD46P15529 392 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-211ENST00000620944 CD96P40200 585 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms