RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 CLEC20AQ6ZU45 233 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PIGWQ7Z7B1 504 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 RPAINQ86UA6 219 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PIGZQ86VD9 579 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DDIASQ8IXT1 998 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC34Q8IZ02 419 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 RBFAQ8N0V3 343 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DEFB106AQ8N104 65 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PQLC3Q8N755 202 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SCCPDHQ8NBX0 429 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DBF4BQ8NFT6 615 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CEP76Q8TAP6 659 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ERGIC1Q969X5 290 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC39Q96DD0 335 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SENP8Q96LD8 212 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TSGA13Q96PP4 275 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CYTH2Q99418 400 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SYT15Q9BQS2 421 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 INPP5KQ9BT40 448 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SPXQ9BT56 116 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 EFHD1Q9BUP0 239 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CACNG6Q9BXT2 260 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DUSP16Q9BY84 665 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 RAB6CQ9H0N0 254 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TRABDQ9H4I3 376 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 POPDC2Q9HBU9 364 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ETNK2Q9NVF9 386 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 HPF1Q9NWY4 346 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SERGEFQ9UGK8 458 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CDH9Q9ULB4 789 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 FZD10Q9ULW2 581 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CHMP2BQ9UQN3 213 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 HEY1Q9Y5J3 304 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 IKBKGQ9Y6K9 419 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PLXNA3P51805 1871 aa4.02□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 C5orf52A6NGY3 159 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TCP11X1B4DZS4 312 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 KBTBD13C9JR72 458 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ANKRD65E5RJM6 399 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 M0QZ24 198 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MGST3O14880 152 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TM9SF1O15321 606 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 VEGFDO43915 354 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SNX3O60493 162 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 BANF1O75531 89 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 NDUFB4O95168 129 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 OAS1P00973 400 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 GSTA1P08263 222 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MAOAP21397 527 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CA4P22748 312 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 IL4RP24394 825 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 GCAP28676 217 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SSTR1P30872 391 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 GABRA5P31644 462 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL9P32969 192 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PLA2G5P39877 138 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ELK3P41970 407 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MAGEA6P43360 314 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 AVPR1BP47901 424 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 KHKP50053 298 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TKTL1P51854 596 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 NME5P56597 212 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DAOAP59103 153 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1024LP59773 190 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 GPX6P59796 221 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 GAD2Q05329 585 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MGAT3Q09327 533 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 HSPB3Q12988 150 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 PDK1Q15118 436 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CA9Q16790 459 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 DCAF6Q58WW2 860 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 LGSNQ5TDP6 509 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 HHATQ5VTY9 493 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 WSCD1Q658N2 575 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM71Q6P5X7 295 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CXCL17Q6UXB2 119 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 NHLRC1Q6VVB1 395 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 RGS9BPQ6ZS82 235 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 KCTD9Q7L273 389 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC190Q86UF4 302 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 SERINC5Q86VE9 423 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM131BQ86XD5 332 aa4.01□□□□□ -1.77
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM219AQ8IW50 185 aa4.01□□□□□ -1.77
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