RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587563.5

RPRD1A-205, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, human

TSL 3

Gene RPRD1A, Length 643 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPRD1A-205	ENST00000587563	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	LSMEM2	Q8N112	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	FAM109A	Q8N4B1	249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CEP112	Q8N8E3	955 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NAT6	Q93015	286 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	LRRC45	Q96CN5	670 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NUS1	Q96E22	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PPP1R2P1	Q96PQ5	205 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TRIB3	Q96RU7	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NRTN	Q99748	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	APMAP	Q9HDC9	416 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MRPS18B	Q9Y676	258 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RELN	P78509	3460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563		A0A0J9YYE9	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NKX2-8	O15522	239 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MTX2	O75431	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	AP2A1	O95782	977 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	EPO	P01588	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TRBC1	P01850	177 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PSG1	P11464	419 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	LIF	P15018	202 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	BRAF	P15056	766 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	HLA-DPA1	P20036	260 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NR1D1	P20393	614 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	F8A1	P23610	371 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NFKBIA	P25963	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ADRA1A	P35348	466 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	UGT1A3	P35503	534 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	GRIA1	P42261	906 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	HSPA7	P48741	367 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SUOX	P51687	545 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ARL4C	P56559	192 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PPP1CA	P62136	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TLE1	Q04724	770 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	IGFBP7	Q16270	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PYCR3	Q53H96	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ICE2	Q659A1	982 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	KCTD11	Q693B1	232 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	C8orf74	Q6P047	294 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	BMPER	Q8N8U9	685 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	OR52K1	Q8NGK4	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	CPT1B	Q92523	772 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ART4	Q93070	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	SCRN2	Q96FV2	425 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MED8	Q96G25	268 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	ERP44	Q9BS26	406 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	LRRC40	Q9H9A6	602 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RPRD1A-205	ENST00000587563	RASSF1	Q9NS23	344 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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