RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa16.05■□□□□ 0.16
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CCNDBP1-211ENST00000567434 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa16.02■□□□□ 0.16
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CCNDBP1-211ENST00000567434 L3MBTL4Q8NA19 623 aa16.02■□□□□ 0.16
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