RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563261.5

SNAI3-AS1-201, SNAI3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAI3-AS1, Length 998 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RAB38P57729 211 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IFT88Q13099 833 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CUL3Q13618 768 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RUNX2Q13950 521 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RCN2Q14257 317 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MYBPC3Q14896 1274 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AP5B1Q2VPB7 878 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LETMD1Q6P1Q0 360 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 QSOX2Q6ZRP7 698 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NDUFAF7Q7L592 441 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 UBE3DQ7Z6J8 389 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CROCCP2Q86T23 111 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IQCKQ8N0W5 287 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RNF175Q8N4F7 328 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FDCSPQ8NFU4 85 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RGMAQ96B86 450 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMC6Q96SB8 1091 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF700Q9H0M5 742 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLLPQ9Y342 182 aa20.89■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A0A1B0GTL3 188 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PPP6CO00743 305 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SH3BGRLO75368 114 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C1QL1O75973 258 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CPA3P15088 417 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ITGA3P26006 1051 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PGDP52209 483 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DNAJB13P59910 316 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LCP2Q13094 533 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ABRAXAS2Q15018 415 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF793Q6ZN11 406 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LANCL3Q6ZV70 420 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ACOT4Q8N9L9 421 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SERPINI1Q99574 410 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 GSTO2Q9H4Y5 243 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ELOVL6Q9H5J4 265 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF160Q9HCG1 818 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LYRM4Q9HD34 91 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 DAPP1Q9UN19 280 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SNX6Q9UNH7 406 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MMACHCQ9Y4U1 282 aa20.88■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 A6NL46 340 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 MASP2O00187 686 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SAP18O00422 153 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RTCAO00442 366 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 B4GALT2O60909 372 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR4F21O95013 312 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SEMA3DO95025 777 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NEK2P51955 445 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LIM2P55344 173 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PKNOX1P55347 436 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NFATC3Q12968 1075 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PCOLCEQ15113 449 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NSDHLQ15738 373 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR4C11Q6IEV9 310 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ANKRD37Q7Z713 158 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF843Q8N446 348 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CCNYL1Q8N7R7 359 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZIM3Q96PE6 472 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TUBB6Q9BUF5 446 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 NUDT9Q9BW91 350 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SLC29A3Q9BZD2 475 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRDM9Q9NQV7 894 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OXSMQ9NWU1 459 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF225Q9UK10 706 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATRXP46100 2492 aa20.87■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ATMQ13315 3056 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 OR2W5A6NFC9 320 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 H3BQF6 201 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PLPP1O14494 284 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PRMT3O60678 531 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ALPPP05187 535 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 AP2B1P63010 937 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CEP85LQ5SZL2 805 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LIPMQ5VYY2 423 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ASB18Q6ZVZ8 466 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 HPS6Q86YV9 775 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 PARP9Q8IXQ6 854 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZNF595Q8IYB9 648 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ARMC2Q8NEN0 867 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 TSLPQ969D9 159 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 LHPPQ9H008 270 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 SPACA6W5XKT8 324 aa20.86■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 FAM227AF5H4B4 570 aa20.85■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 K7EM74 188 aa20.85■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 CLDN4O14493 209 aa20.85■□□□□ 0.93
SNAI3-AS1-201ENST00000563261 ETHE1O95571 254 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms