RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KEAP1Q14145 624 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UAP1L1Q3KQV9 507 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IFI44LQ53G44 452 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RNF130Q86XS8 419 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBC1D19Q8N5T2 526 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RUBCNLQ9H714 662 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CXorf21Q9HAI6 301 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRBC2A0A5B9 178 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PDPK1O15530 556 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ABCB7O75027 752 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CPNE6O95741 557 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GRK3P35626 688 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DAPP51397 102 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CRYBA2P53672 197 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ABATP80404 500 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CD47Q08722 323 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC5A12Q1EHB4 618 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PRSS53Q2L4Q9 553 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM35AQ53FP2 167 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADCK2Q7Z695 626 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CYP4Z1Q86W10 505 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL17RCQ8NAC3 791 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NFKBIDQ8NI38 313 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NRTNQ99748 197 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NEUROD4Q9HD90 331 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACSL6Q9UKU0 697 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa20.36■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADAMDEC1O15204 470 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DIRAS1O95057 198 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARAFP10398 606 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ITGA2P17301 1181 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTHP32929 405 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ISL1P61371 349 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CLCA4Q14CN2 919 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IQCCQ4KMZ1 466 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR2A1Q8NGT9 310 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPPL2AQ8TCT8 520 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RIBC2Q9H4K1 309 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.35■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RTCAO00442 366 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ADAM23O75077 832 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL7RP16871 459 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MANFP55145 182 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DSTNP60981 165 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PMS2P3Q13401 168 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HTR4Q13639 388 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MEP1AQ16819 746 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CRB2Q5IJ48 1285 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAHD1Q6P587 224 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 USP30Q70CQ3 517 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GALNT5Q7Z7M9 940 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATG16L2Q8NAA4 619 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR5AK3PQ8NH89 298 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FBLIM1Q8WUP2 373 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAGED4Q96JG8 741 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 APOL4Q9BPW4 351 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 XKR8Q9H6D3 395 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT84Q9NSB2 600 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A0A1W2PQF6 199 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MITFO75030 526 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EGFP01133 1207 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC159P0C7I6 412 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ALDH9A1P49189 494 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIAA1024LP59773 190 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAB39AQ14964 217 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RPE65Q16518 533 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MMP21Q8N119 569 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR52E1Q8NGJ3 308 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF566Q969W8 418 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ISOC1Q96CN7 298 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NEURL3Q96EH8 262 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR2M4Q96R27 311 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CXorf36Q9H7Y0 433 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM184CQ9NVA4 438 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SNX8Q9Y5X2 465 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa20.34■□□□□ 0.85
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM229AB2RXF0 380 aa20.33■□□□□ 0.84
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LATO43561 262 aa20.33■□□□□ 0.84
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DRD2P14416 443 aa20.33■□□□□ 0.84
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COL9A1P20849 921 aa20.33■□□□□ 0.84
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL5RAQ01344 420 aa20.33■□□□□ 0.84
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IL1RL1Q01638 556 aa20.33■□□□□ 0.84
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TUBA3CQ13748 450 aa20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms