RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-206ENST00000554292 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa26.79■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 MAGEB17A8MXT2 336 aa26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 SSR2P43308 183 aa26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 PGDP52209 483 aa26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 SOX8P57073 446 aa26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 RAB38P57729 211 aa26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 DNAJB13P59910 316 aa26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 RPS13P62277 151 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 LCP2Q13094 533 aa26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 CCNYL1Q8N7R7 359 aa26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 SERPINI1Q99574 410 aa26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 PRDM7Q9NQW5 492 aa26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 PLLPQ9Y342 182 aa26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 SPACA6W5XKT8 324 aa26.78■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 B4GALT2O60909 372 aa26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 SCELO95171 688 aa26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 COX6A1P12074 109 aa26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 TSPAN8P19075 237 aa26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 CERS1P27544 350 aa26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 PKNOX1P55347 436 aa26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 AP2B1P63010 937 aa26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 RHAGQ02094 409 aa26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 CUL3Q13618 768 aa26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 ABRAXAS2Q15018 415 aa26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 LETMD1Q6P1Q0 360 aa26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 QSOX2Q6ZRP7 698 aa26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 IQCKQ8N0W5 287 aa26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa26.77■■□□□ 1.88
PCNX1-206ENST00000554292 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 A6NL46 340 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 H3BQF6 201 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 DNAJB6O75190 326 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 SH3BGRLO75368 114 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ALPPP05187 535 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ITGA3P26006 1051 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ASPHQ12797 758 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 RUNX2Q13950 521 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 MYBPC3Q14896 1274 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 NSDHLQ15738 373 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 CFAP157Q5JU67 520 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 CEP85LQ5SZL2 805 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 LRIG3Q6UXM1 1119 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 UBE3DQ7Z6J8 389 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ACOT4Q8N9L9 421 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ARMC2Q8NEN0 867 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 TUBB6Q9BUF5 446 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 SLC29A3Q9BZD2 475 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ZNF700Q9H0M5 742 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ZNF160Q9HCG1 818 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 LYRM4Q9HD34 91 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 OXSMQ9NWU1 459 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 DAPP1Q9UN19 280 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 MMACHCQ9Y4U1 282 aa26.76■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 CLDN4O14493 209 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 PRMT3O60678 531 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 OR4F21O95013 312 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 SEMA3DO95025 777 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 NEK2P51955 445 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 LIPMQ5VYY2 423 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 OR4C11Q6IEV9 310 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 HPS6Q86YV9 775 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 RNF175Q8N4F7 328 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 FDCSPQ8NFU4 85 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ZIM3Q96PE6 472 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 GSTO2Q9H4Y5 243 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 MLXIPLQ9NP71 852 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 PRDM9Q9NQV7 894 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 SAP18O00422 153 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 PPP6CO00743 305 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 KRT6AP02538 564 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 KRT6BP04259 564 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ENO1P06733 434 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ICAM2P13598 275 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 KRT6CP48668 564 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 EFNA3P52797 238 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 LIM2P55344 173 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 NFATC3Q12968 1075 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 PCOLCEQ15113 449 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 LANCL3Q6ZV70 420 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ASB18Q6ZVZ8 466 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 ANKRD37Q7Z713 158 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 KBTBD2Q8IY47 623 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 SHISA5Q8N114 240 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 PTCHD1Q96NR3 888 aa26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 RTCAO00442 366 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 PLPP1O14494 284 aa26.73■■□□□ 1.87
PCNX1-206ENST00000554292 SPAG7O75391 227 aa26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms