RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TLR9	Q9NR96	1032 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PTCH1	Q13635	1447 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	SMCO3	A2RU48	225 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	METTL12	A8MUP2	240 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	DUX1	O43812	170 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CNIH1	O95406	144 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TDP2	O95551	362 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM107A	O95990	144 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ITPKA	P23677	461 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	FPR3	P25089	353 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	GIF	P27352	417 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	RGS6	P49758	472 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	EPHA4	P54764	986 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CSNK1G2	P78368	415 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PITPNA	Q00169	270 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	EVX2	Q03828	476 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CD300C	Q08708	224 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	BAMBI	Q13145	260 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC29A2	Q14542	456 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ITIH4	Q14624	930 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	SHB	Q15464	509 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	BEND3	Q5T5X7	828 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	MMP21	Q8N119	569 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM47B	Q8NA70	645 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	LENG9	Q96B70	501 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	DUX5	Q96PT3	197 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ALG12	Q9BV10	488 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	NUDT9	Q9BW91	350 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD60	Q9BZ19	345 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	USP3	Q9Y6I4	520 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483		E5RJQ4	531 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ACOT7	O00154	380 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TRIM24	O15164	1050 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	MFAP3L	O75121	409 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ITGA10	O75578	1167 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PNLIP	P16233	465 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TPSB2	P20231	275 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC6A2	P23975	617 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	KHK	P50053	298 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	MLLT10	P55197	1068 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CDH13	P55290	713 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PLAUR	Q03405	335 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ITGAD	Q13349	1161 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PTPRCAP	Q14761	206 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TPSAB1	Q15661	275 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TAB1	Q15750	504 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CARD16	Q5EG05	197 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PLA2G15	Q8NCC3	412 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CDS1	Q92903	461 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC38A4	Q969I6	547 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	MED18	Q9BUE0	208 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	RASD1	Q9Y272	281 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	NPTN	Q9Y639	398 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	ERCC6	Q03468	1493 aa		3.73	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC35F4	A4IF30	521 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CHAD	O15335	359 aa		3.72	□□□□□ -1.81
CNOT2-231	ENST00000551483	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81

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