RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 ISPDA4D126 451 aa8.19□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 KXD1Q9BQD3 176 aa8.19□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 OR4C11Q6IEV9 310 aa8.19□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 DDIT4LQ96D03 193 aa8.18□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa8.18□□□□□ -1.1
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PTPRB-208ENST00000550358 PORP16435 677 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRB-208ENST00000550358 RYKP34925 604 aa8.18□□□□□ -1.1
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