RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 CHSY3Q70JA7 882 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 RNF175Q8N4F7 328 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 L3MBTL4Q8NA19 623 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 DNAJB14Q8TBM8 379 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 MZB1Q8WU39 189 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 KCNC2Q96PR1 638 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 LPAR4Q99677 370 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 TBCDQ9BTW9 1192 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 ROGDIQ9GZN7 287 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 NECTIN3Q9NQS3 549 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa20.53■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 A8MT66 165 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 H0YIV9 168 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 GOLGA8RI6L899 631 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 RTCAO00442 366 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 OR7A17O14581 309 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 PIK3CBP42338 1070 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 LIM2P55344 173 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 EXT1Q16394 746 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 ZNF793Q6ZN11 406 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 CUZD1Q86UP6 607 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 CYP4X1Q8N118 509 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 ACMSDQ8TDX5 336 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 ATP6V1E2Q96A05 226 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 CNDP1Q96KN2 507 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 CDK15Q96Q40 435 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 OR51B5Q9H339 312 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 DAPP1Q9UN19 280 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 MMACHCQ9Y4U1 282 aa20.52■□□□□ 0.88
PUS1-211ENST00000544662 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 SAP18O00422 153 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 CLDN9O95484 217 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 PYGBP11216 843 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 CCNG1P51959 295 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 AP5B1Q2VPB7 878 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 DEPDC1Q5TB30 811 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 LCA5Q86VQ0 697 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 IQCKQ8N0W5 287 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 CNPY4Q8N129 248 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 ACOT4Q8N9L9 421 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 FAM47BQ8NA70 645 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 TMEM52Q8NDY8 209 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 ARMC2Q8NEN0 867 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 OR52B6Q8NGF0 335 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 M1APQ8TC57 530 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 REPS1Q96D71 796 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 CLMPQ9H6B4 373 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 ZBTB26Q9HCK0 441 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 DMRT3Q9NQL9 472 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 PLA2G3Q9NZ20 509 aa20.51■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 RPS17P08708 135 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 SLC26A5P58743 744 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 RPS13P62277 151 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 PHEXP78562 749 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 SCUBE1Q8IWY4 988 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 CSF3RQ99062 836 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 NTMT1Q9BV86 223 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 KCNK13Q9HB14 408 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 LYRM4Q9HD34 91 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 MMP25Q9NPA2 562 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 KCMF1Q9P0J7 381 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa20.5■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 A0A1W2PPM1 405 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 A8MUA0 341 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 A8MUI8 341 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 FOXO6A8MYZ6 492 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 CYR61O00622 381 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 CLDN4O14493 209 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 SCELO95171 688 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 TAC1P20366 129 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 SSR2P43308 183 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 SLCO1A2P46721 670 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 NEK2P51955 445 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 RAP1GDS1P52306 607 aa20.49■□□□□ 0.87
PUS1-211ENST00000544662 HSD17B7P56937 341 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms