RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 OR1A2Q9Y585 309 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ANTXRLA6NF34 631 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 GNB5O14775 395 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 DFNA5O60443 496 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 AP2A2O94973 939 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ATE1O95260 518 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PDGFAP04085 211 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 GLAP06280 429 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HOXA6P31267 233 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CLCNKAP51800 687 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 AAK1Q2M2I8 961 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 OR4F3Q6IEY1 312 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 GALNT18Q6P9A2 607 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 DPPA4Q7L190 304 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 KRT74Q7RTS7 529 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 RAD51AP1Q96B01 352 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ARRDC3Q96B67 414 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 DTD2Q96FN9 168 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 DOK1Q99704 481 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 COQ10BQ9H8M1 238 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 VPS29Q9UBQ0 182 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF221Q9UK13 617 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 U3KQV3 271 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PLXNA3P51805 1871 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 A6NCN8 305 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CCNKO75909 580 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MAOBP27338 520 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 AQP1P29972 269 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CASP9P55211 416 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 DOC2AQ14183 400 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 RCAN2Q14206 197 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 GALNT12Q8IXK2 581 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF786Q8N393 782 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 WDR26Q9H7D7 661 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CRLF2Q9HC73 371 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MAP10Q9P2G4 905 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 KCNK6Q9Y257 313 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MYLKQ15746 1914 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 E7EQ34 232 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 GFRA2O00451 464 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CCNDBP1O95273 360 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MATN4O95460 622 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 H6PDO95479 791 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 IL6P05231 212 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ITGB7P26010 798 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SLC7A1P30825 629 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CAPZA2P47755 286 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PRIM2P49643 509 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CST6Q15828 149 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MED27Q6P2C8 311 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 C17orf64Q86WR6 236 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ARMC8Q8IUR7 673 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CBR4Q8N4T8 237 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TESCQ96BS2 214 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 BDH2Q9BUT1 245 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 FZD3Q9NPG1 666 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CMTM6Q9NX76 183 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ST14Q9Y5Y6 855 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa7.54□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 A0A0G2JN53 185 aa7.53□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 DBX1A6NMT0 343 aa7.53□□□□□ -1.2
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