RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495899.1

MRPL55-233, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, human

TSL 2

Gene MRPL55, Length 790 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL55-233	ENST00000495899	KRT15	P19012	456 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	CCT5	P48643	541 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	EFNA3	P52797	238 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	PLA2G16	P53816	162 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	MTTP	P55157	894 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	HERVK_113	P63132	956 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	OLR1	P78380	273 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	PHEX	P78562	749 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899		Q0VFX4	171 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	RAPSN	Q13702	412 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	RCN2	Q14257	317 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	PCOLCE	Q15113	449 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	SHISA5	Q8N114	240 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	CA13	Q8N1Q1	262 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	CAVIN3	Q969G5	261 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	F2RL3	Q96RI0	385 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	LMF1	Q96S06	567 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	CENPK	Q9BS16	269 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	PPT2	Q9UMR5	302 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899		A0A1W2PPM1	405 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899		A8MT66	165 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	GOLGA8R	I6L899	631 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	CLDN4	O14493	209 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	B4GALT2	O60909	372 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	SCEL	O95171	688 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	OTC	P00480	354 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	PRR35	P0CG20	571 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	SLCO1A2	P46721	670 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	CCNG1	P51959	295 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	HSD17B7	P56937	341 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	CUL3	Q13618	768 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	RUNX2	Q13950	521 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	RGMA	Q96B86	450 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	CCDC126	Q96EE4	140 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	UCN2	Q96RP3	112 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	LYRM4	Q9HD34	91 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		11.63	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	BLACE	A4D250	179 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	OR2W5	A6NFC9	320 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	FAM227A	F5H4B4	570 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899		J3QKU1	62 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	DLX3	O60479	287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	GLRA3	O75311	464 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	TGFB1	P01137	390 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	IMPDH1	P20839	514 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	CRHR1	P34998	444 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	RAB38	P57729	211 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	OR4D2	P58180	307 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	NAA20	P61599	178 aa		11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
MRPL55-233	ENST00000495899	EXT1	Q16394	746 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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