RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SH2B3Q9UQQ2 575 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TRPM6Q9BX84 2022 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 A0A087WXM4 84 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 A0A096LPI6 279 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MYO1GB0I1T2 1018 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CLIC1O00299 241 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CCRL2O00421 344 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 HS6ST1O60243 411 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CER1O95813 267 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 THRBP10828 461 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ENGP17813 658 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 MAPK1P28482 360 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SHMT2P34897 504 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RAB15P59190 212 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RPS13P62277 151 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GGTA1PQ4G0N0 100 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 STPG1Q5TH74 334 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DTX3Q8N9I9 347 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 OR7G3Q8NG95 312 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 HUS1BQ8NHY5 278 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZNF480Q8WV37 535 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SNX19Q92543 992 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SGCDQ92629 289 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 KXD1Q9BQD3 176 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TOR3AQ9H497 397 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NINQ8N4C6 2090 aa6.72□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SLC5A10A0PJK1 596 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SNTNA6NMZ2 147 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SLC16A5O15375 505 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 AP2A2O94973 939 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 SCELO95171 688 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TGFB1P01137 390 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ALPLP05186 524 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 C6P13671 934 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 IL7RP16871 459 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PTPN6P29350 595 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 PRLHRP49683 370 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TPTEP56180 551 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DCDC1P59894 354 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 TBPL1P62380 186 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 BNC1Q01954 994 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 NFE2L1Q14494 772 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CARTPTQ16568 116 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 GALNT5Q7Z7M9 940 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 RAB7BQ96AH8 199 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 OMA1Q96E52 524 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 DTD2Q96FN9 168 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 OR51B5Q9H339 312 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 ASIC5Q9NY37 505 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 CDC14AQ9UNH5 594 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.71□□□□□ -1.33
HERC4-211ENST00000492996 LRRK1Q38SD2 2015 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SZT2Q5T011 3432 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MGAT4DA6NG13 374 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 H0Y858 1186 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KMOO15229 486 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SPINT1O43278 529 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 AQP9O43315 295 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SH3BP5O60239 455 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 POP7O75817 140 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FKBP9O95302 570 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PRNPP04156 253 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NUDT7P0C024 238 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GABRG2P18507 467 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PRPS1L1P21108 318 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PIGAP37287 484 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ALDH3A2P51648 485 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ESRRGP62508 458 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PIGFQ07326 219 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TUBA3CQ13748 450 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 LIPJQ5W064 366 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ATG9BQ674R7 924 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TUBA3EQ6PEY2 450 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FKBP9P1Q75LS8 142 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DEPDC4Q8N2C3 294 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 AADATQ8N5Z0 425 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms