RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		7.91	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	PCTP	Q9UKL6	214 aa		7.91	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	7.91	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		7.91	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		7.91	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		7.91	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		7.91	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		7.91	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	BLACE	A4D250	179 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128		A8MT66	165 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128		H3BQF6	201 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	OTC	P00480	354 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	HP	P00738	406 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	SBK3	P0C264	359 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	ACPP	P15309	386 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	KRT15	P19012	456 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	NOS3	P29474	1203 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	CRHR1	P34998	444 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	XCR1	P46094	333 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	CCT5	P48643	541 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	PHEX	P78562	749 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	SLC18A2	Q05940	514 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	ZNF33B	Q06732	778 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	RCN2	Q14257	317 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	RBBP7	Q16576	425 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	DEFB134	Q4QY38	66 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	CROCCP2	Q86T23	111 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	TEX9	Q8N6V9	391 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	EXD3	Q8N9H8	876 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	OR7G3	Q8NG95	312 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	MOCOS	Q96EN8	888 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	SCYL1	Q96KG9	808 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	CENPK	Q9BS16	269 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	MS4A8	Q9BY19	250 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	IPPK	Q9H8X2	491 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	ACTR8	Q9H981	624 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	ACSS2	Q9NR19	701 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	C5AR2	Q9P296	337 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	TBK1	Q9UHD2	729 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	MID2	Q9UJV3	735 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	C3orf18	Q9UK00	162 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	7.9	□□□□□ -1.14
USP34-208	ENST00000467128	ARGFX	A6NJG6	315 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	SGK494	L7N484	410 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	OR7A17	O14581	309 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	RDH16	O75452	317 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	SEMA3D	O95025	777 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	CLDN9	O95484	217 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	MLYCD	O95822	493 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	ALPP	P05187	535 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	FH	P07954	510 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	FAM87A	P0C7U9	286 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	COX6A1	P12074	109 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	OTX2	P32243	289 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	CCNG1	P51959	295 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	PRKAA2	P54646	552 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	MTTP	P55157	894 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	TRAF3	Q13114	568 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	CUL3	Q13618	768 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	MYBPC3	Q14896	1274 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	TERF2	Q15554	542 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		7.89	□□□□□ -1.15
USP34-208	ENST00000467128	VWA2	Q5GFL6	755 aa		7.89	□□□□□ -1.15

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