RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLDN9O95484 217 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TGFB1P01137 390 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CELA2AP08217 269 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYBL2P10244 700 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ITGAMP11215 1152 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PIK3CBP42338 1070 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RAB38P57729 211 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AP5B1Q2VPB7 878 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ABHD17BQ5VST6 288 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IGFL2Q6UWQ7 119 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACMSDQ8TDX5 336 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPCSQ9HAB8 311 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLAAQ9Y263 795 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MMACHCQ9Y4U1 282 aa18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
HOXB-AS3-204ENST00000466037 A8MUI8 341 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM227AF5H4B4 570 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VPS4BO75351 444 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SH3BGRLO75368 114 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MAOAP21397 527 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CERS1P27544 350 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SSR2P43308 183 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TAS2R50P59544 299 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BTG2P78543 158 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC13A2Q13183 592 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RUNX2Q13950 521 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TLR1Q15399 786 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 Q6ZS92 163 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM47BQ8NA70 645 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HUS1BQ8NHY5 278 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 M1APQ8TC57 530 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 QRFPRQ96P65 431 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EPB41L4BQ9H329 900 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNK13Q9HB14 408 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VPS4AQ9UN37 437 aa18.58■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NBASA2RRP1 2371 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 H0YIV9 168 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GOLGA8RI6L899 631 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF33BQ06732 778 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF595Q8IYB9 648 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 Q8NA96 180 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PSMF1Q92530 271 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MIB2Q96AX9 1013 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RGMAQ96B86 450 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC29A3Q9BZD2 475 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR51B5Q9H339 312 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DMRT3Q9NQL9 472 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ABI3Q9P2A4 366 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCTPQ9UKL6 214 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TENM4Q6N022 2769 aa18.57■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SMIM23A6NLE4 172 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SAP18O00422 153 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLU7O95391 586 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GSTA1P08263 222 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PYGBP11216 843 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KRT15P19012 456 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SOX11P35716 441 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LIM2P55344 173 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HSD17B7P56937 341 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC5A8Q8N695 610 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACOT4Q8N9L9 421 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 L3MBTL4Q8NA19 623 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LYRM4Q9HD34 91 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MMP25Q9NPA2 562 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRDM7Q9NQW5 492 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STMN3Q9NZ72 180 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DAPP1Q9UN19 280 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNF11Q9Y3C5 154 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 A8MT66 165 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RTCAO00442 366 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OTCP00480 354 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TSFMP43897 325 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLCO1A2P46721 670 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC26A5P58743 744 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RPS13P62277 151 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IFT88Q13099 833 aa18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms