RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
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CCBE1-202ENST00000439986 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
CCBE1-202ENST00000439986 PRAMEF10O60809 474 aa11.21□□□□□ -0.62
CCBE1-202ENST00000439986 STK16O75716 305 aa11.21□□□□□ -0.62
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CCBE1-202ENST00000439986 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CCBE1-202ENST00000439986 COMMD4Q9H0A8 199 aa11.2□□□□□ -0.62
CCBE1-202ENST00000439986 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CCBE1-202ENST00000439986 NCDNQ9UBB6 729 aa11.2□□□□□ -0.62
CCBE1-202ENST00000439986 PEX16Q9Y5Y5 336 aa11.2□□□□□ -0.62
CCBE1-202ENST00000439986 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa11.2□□□□□ -0.62
CCBE1-202ENST00000439986 NME6O75414 186 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
CCBE1-202ENST00000439986 PGRP06401 933 aa11.19□□□□□ -0.62
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF823P16415 610 aa11.19□□□□□ -0.62
CCBE1-202ENST00000439986 CLCN7P51798 805 aa11.19□□□□□ -0.62
CCBE1-202ENST00000439986 LUMP51884 338 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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