RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439476.6

BDNF-211, Transcript of brain derived neurotrophic factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BDNF, Length 4,532 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNF-211ENST00000439476 TESMINQ9Y4I5 508 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 ENTPD6O75354 484 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 S1PR4O95977 384 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 CHRNA1P02708 482 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 RLN2P04090 185 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 APODP05090 189 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 ZNF806P0C7X5 589 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 KCNE1P15382 129 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 CD52P31358 61 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 AGTR2P50052 363 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 PLA2G16P53816 162 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 CDKN2DP55273 166 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 SCAPQ12770 1279 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 DOC2AQ14183 400 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 ZNF789Q5FWF6 425 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 COQ5Q5HYK3 327 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 ISCA2Q86U28 154 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 SERPINA9Q86WD7 417 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 RNF31Q96EP0 1072 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 ITPAQ9BY32 194 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 DERL2Q9GZP9 239 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 CST11Q9H112 138 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 CITO14578 2027 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 PAPPAQ13219 1627 aa6.15□□□□□ -1.42
BDNF-211ENST00000439476 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 I3L521 148 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SOCS7O14512 581 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ACOX3O15254 700 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 FFAR2O15552 330 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 HLA-DPB1P04440 258 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SRCP12931 536 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SELPP16109 830 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SMPD1P17405 629 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 GPX3P22352 226 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 UQCRC1P31930 480 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 GRK6P43250 576 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 STC1P52823 247 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 EMX2Q04743 252 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 TMEM17Q86X19 198 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 FCRL4Q96PJ5 515 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SLC2A11Q9BYW1 496 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 TMLHEQ9NVH6 421 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 HS3ST4Q9Y661 456 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 CROCCQ5TZA2 2017 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 A0A1B0GTW7 788 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ZNF195O14628 629 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 DFNA5O60443 496 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 GMDSO60547 372 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 EEDO75530 441 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 DIRAS1O95057 198 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 RCBTB2O95199 551 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 RB1P06400 928 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 GABRR2P28476 465 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 OR1D2P34982 312 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 MAP2K4P45985 399 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 CDH12P55289 794 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 GRB14Q14449 540 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 TRAM1Q15629 374 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 FAM214AQ32MH5 1076 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 CES4AQ5XG92 561 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 LYPD8Q6UX82 237 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 NUDT13Q86X67 352 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ZNF563Q8TA94 476 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 FBXW5Q969U6 566 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 MSANTD3Q96H12 275 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 PYURFQ96I23 114 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 OPALINQ96PE5 141 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 MND1Q9BWT6 205 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 MMP27Q9H306 513 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SLC32A1Q9H598 525 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.15□□□□□ -1.43
BDNF-211ENST00000439476 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
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