RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436404.6

CNGA3-205, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 2,504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-205ENST00000436404 LIN7BQ9HAP6 207 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ING3Q9NXR8 418 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 SLC23A1Q9UHI7 598 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CD207Q9UJ71 328 aa16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 PDE9AO76083 593 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF682O95780 498 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 GLULP15104 373 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ALAS2P22557 587 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 TALDO1P37837 337 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 KIR2DL3P43628 341 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 TP53BP2Q13625 1128 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 GAB4Q2WGN9 574 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 NLRP8Q86W28 1048 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 FAM181AQ8N9Y4 354 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 PMEPA1Q969W9 287 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 GUCD1Q96NT3 240 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 GPR83Q9NYM4 423 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 KCNE2Q9Y6J6 123 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 IL6P05231 212 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ERVPABLB-1P60509 514 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CYP4F2P78329 520 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 PSPHP78330 225 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 IHHQ14623 411 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 MFSD13AQ14CX5 517 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 GPR19Q15760 415 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 GTDC1Q4AE62 458 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ZBTB37Q5TC79 503 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ATCAYQ86WG3 371 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 LAX1Q8IWV1 398 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 DTX3Q8N9I9 347 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 KXD1Q9BQD3 176 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 GABARAPL3Q9BY60 117 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 TMEM245Q9H330 911 aa16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CBX4O00257 560 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CDC7O00311 574 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 DIRAS1O95057 198 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CCNDBP1O95273 360 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CSF2P04141 144 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 FABP3P05413 133 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 PRKACAP17612 351 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 HTR6P50406 440 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 MARC1Q5VT66 337 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 MRNIPQ6NTE8 343 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 PAQR3Q6TCH7 311 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 METTL6Q8TCB7 284 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 TBATAQ96M53 351 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 CDK15Q96Q40 435 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ASPNQ9BXN1 380 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 BARHL1Q9BZE3 327 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 SLC25A51Q9H1U9 297 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 SIRT5Q9NXA8 310 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 PGRP06401 933 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 GGT2P36268 569 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 RPS19P39019 145 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 RORCP51449 518 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 RENBPP51606 427 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ST3GAL4Q11206 333 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 SNTA1Q13424 505 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 TSTQ16762 297 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 TATDN3Q17R31 274 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 GPR153Q6NV75 609 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 LINGO4Q6UY18 593 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 C12orf40Q86WS4 652 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 C10orf111Q8N326 155 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 DCAF4L2Q8NA75 395 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 GPR150Q8NGU9 434 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ESAMQ96AP7 390 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ELSPBP1Q96BH3 223 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-205ENST00000436404 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa16.14■□□□□ 0.17
CNGA3-205ENST00000436404 E2F3O00716 465 aa16.14■□□□□ 0.17
CNGA3-205ENST00000436404 GJB3O75712 270 aa16.14■□□□□ 0.17
CNGA3-205ENST00000436404 GPX5O75715 221 aa16.14■□□□□ 0.17
CNGA3-205ENST00000436404 WDR47O94967 919 aa16.14■□□□□ 0.17
CNGA3-205ENST00000436404 CSF3P09919 207 aa16.14■□□□□ 0.17
CNGA3-205ENST00000436404 SRP54P61011 504 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CNGA3-205ENST00000436404 MAXP61244 160 aa16.14■□□□□ 0.17
CNGA3-205ENST00000436404 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CNGA3-205ENST00000436404 SPANXN4Q5MJ08 99 aa16.14■□□□□ 0.17
CNGA3-205ENST00000436404 OR52B6Q8NGF0 335 aa16.14■□□□□ 0.17
CNGA3-205ENST00000436404 OR8H1Q8NGG4 311 aa16.14■□□□□ 0.17
CNGA3-205ENST00000436404 ENKURQ8TC29 256 aa16.14■□□□□ 0.17
CNGA3-205ENST00000436404 HBEGFQ99075 208 aa16.14■□□□□ 0.17
CNGA3-205ENST00000436404 MGLLQ99685 303 aa16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms