RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA9Q9BWV2 254 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A14Q9Y267 594 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 YIPF1Q9Y548 306 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EML5Q05BV3 1969 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RTTNQ86VV8 2226 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 F5H5T6 163 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RAD51BO15315 384 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS14O43566 566 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC2LP0C7M8 214 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MPC1LP0DKB6 136 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO43Q4G163 708 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 BRAT1Q6PJG6 821 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IFNL1Q8IU54 200 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP21Q8N119 569 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CXorf40BQ96DE9 158 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KATNB1Q9BVA0 655 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ROGDIQ9GZN7 287 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00597Q9H2U6 94 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DAPK2Q9UIK4 370 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GMPPBQ9Y5P6 360 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C7orf66A4D0T2 115 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 WWP2O00308 870 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FABP3P05413 133 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HMBSP08397 361 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CBSLP0DN79 551 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ACADLP28330 430 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CBSP35520 551 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PSPHP78330 225 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 STARD3Q14849 445 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OCLNQ16625 522 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PGBD2Q6P3X8 592 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HOMEZQ8IX15 550 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NPAS3Q8IXF0 933 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PROKR2Q8NFJ6 384 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FIBINQ8TAL6 211 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SAGE2PA6NJ88 616 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 QSOX1O00391 747 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ETFAP13804 333 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ANXA8P13928 327 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SPINT3P49223 89 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 STK19P49842 368 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GAB4Q2WGN9 574 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRK1Q38SD2 2015 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SYT14P1Q58G82 188 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM107Q6UX40 140 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMC5Q6UXY8 1006 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DENND1CQ8IV53 801 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EFHBQ8N7U6 833 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF675Q8TD23 568 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RMDN1Q96DB5 314 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CFHR5Q9BXR6 569 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 STARD7Q9NQZ5 370 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TPRKBQ9Y3C4 175 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX11Q9Y5W9 270 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NPTNQ9Y639 398 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ANTXRLA6NF34 631 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC28A1O00337 649 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PPM1DO15297 605 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA0513O60268 411 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MFN2O95140 757 aa3.46□□□□□ -1.86
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PGGT1B-203ENST00000419445 FLT3LGP49771 235 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ARFIP1P53367 373 aa3.46□□□□□ -1.86
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PGGT1B-203ENST00000419445 GLB1LQ6UWU2 654 aa3.46□□□□□ -1.86
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PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF540Q8NDQ6 660 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4M2Q8NGB6 313 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR52N2Q8NGI0 321 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6K2Q8NGY2 324 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HPS1Q92902 700 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HGDQ93099 445 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NEIL2Q969S2 332 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 UPRTQ96BW1 309 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC3BQ96PB8 259 aa3.46□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
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