RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 ALG11Q2TAA5 492 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 PROX2Q3B8N5 592 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 AP1G1O43747 822 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SERPINA3P01011 423 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 RLN1P04808 185 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 AGXTP21549 392 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 MNDAP41218 407 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 GMFBP60983 142 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 PGBD5Q8N414 524 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ITFG2Q969R8 447 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SMIM14Q96QK8 99 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 MSRAQ9UJ68 235 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 DLGAP1O14490 977 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 LSM1O15116 133 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 HLA-EP13747 358 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SDC1P18827 310 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 PHC1P78364 1004 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC36A4Q6YBV0 504 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 OR8J1Q8NGP2 316 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 STATHP02808 62 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 PORP16435 677 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SEC13P55735 322 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 RAB8AP61006 207 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 CTSL3PQ5NE16 218 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ATAT1Q5SQI0 421 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 MANEALQ5VSG8 457 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 GAB3Q8WWW8 586 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 HERVK_113Q902F9 699 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 GTF2H4Q92759 462 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 FATE1Q969F0 183 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 GINS4Q9BRT9 223 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 TMED9Q9BVK6 235 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 BTBD1Q9H0C5 482 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 MCIDASD6RGH6 385 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 E2F3O00716 465 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 YES1P07947 543 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ACTR1BP42025 376 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 APLP1P51693 650 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 BMXP51813 675 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 PPP5CP53041 499 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ACTR1AP61163 376 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 BTN3A2P78410 334 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 KEAP1Q14145 624 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 GPR78Q96P69 363 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 S100A13Q99584 98 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 C17orf62Q9BQA9 187 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 PDCD10Q9BUL8 212 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 UGDHO60701 494 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 RCBTB2O95199 551 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SRCP12931 536 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ITIH1P19827 911 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 TGFBR2P37173 567 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 PITPNAQ00169 270 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 RAB33AQ14088 237 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 VEZF1Q14119 521 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 TRAM2Q15035 370 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SPRED1Q7Z699 444 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC5A8Q8N695 610 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 OR52N2Q8NGI0 321 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 MAL2Q969L2 176 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 TIGARQ9NQ88 270 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 OLAHQ9NV23 265 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 XKRYO14609 159 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 VILLO15195 856 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ENTPD6O75354 484 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 REM1O75628 298 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 CKMT1AP12532 417 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SERPINA11Q86U17 422 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ACPTQ9BZG2 426 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 CD300AQ9UGN4 299 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 E7EQ34 232 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF195O14628 629 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 MUSKO15146 869 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 TEX28O15482 410 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC10A3P09131 477 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 C8orf89P0DMQ9 161 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ARNTP27540 789 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 OPRL1P41146 370 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 ARL9Q6T311 187 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 FUNDC1Q8IVP5 155 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRN2-201ENST00000389413 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms