RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ACEP12821 1306 aa-2.43□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 A0A1W2PRB8 838 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC154A6NI56 674 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR6C70A6NIJ9 312 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 YDJCA8MPS7 323 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 H7C0S8 307 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SAP18O00422 153 aaKnown RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TAPBPO15533 448 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PCCBP05166 539 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PSMC4P43686 418 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRAPPC10P48553 1259 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IFT88Q13099 833 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ITPK1Q13572 414 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CNPY1Q3B7I2 92 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPINK9Q5DT21 86 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 THEM4Q5T1C6 240 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CYS1Q717R9 158 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CHST9Q7L1S5 443 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TTC30AQ86WT1 665 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPATA6LQ8N4H0 392 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 APPL2Q8NEU8 664 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GJC3Q8NFK1 279 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRIM54Q9BYV2 358 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 THAP2Q9H0W7 228 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RABEP2Q9H5N1 569 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SAYSD1Q9NPB0 183 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DEPPQ9NTK1 212 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR12D3Q9UGF7 316 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PADI3Q9ULW8 664 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANGPT4Q9Y264 503 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa-2.44□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CACNA1HO95180 2353 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRABD2BA6NFA1 517 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EFCAB7A8K855 629 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RAB27BO00194 218 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RNF103O00237 685 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANKRD28O15084 1053 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ZNF749O43361 778 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FCGR3BO75015 233 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NPIPB7O75200 414 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TSPAN9O75954 239 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADRA2AP08913 450 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IFITM1P13164 125 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FCGR2CP31995 323 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 XCR1P46094 333 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 POU3F4P49335 361 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CDK7P50613 346 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NR1H2P55055 460 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FOXL2P58012 376 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TLE2Q04725 743 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 BTKQ06187 659 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PLAG1Q6DJT9 500 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANKRD54Q6NXT1 300 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM136Q6ZRR5 245 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RNF165Q6ZSG1 346 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LINGO2Q7L985 606 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PCP2Q8IVA1 136 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LINC01561Q8N1V8 128 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBXO39Q8N4B4 442 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SETD9Q8NE22 299 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KCNA7Q96RP8 456 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HSD17B14Q9BPX1 270 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FBXO8Q9NRD0 319 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CLDN16Q9Y5I7 305 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-2.45□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 POM121BA6NF01 834 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LRRC14BA6NHZ5 514 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC1A7O00341 560 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LAD1O00515 517 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AQP9O43315 295 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC25A17O43808 307 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 WISP2O76076 250 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CBX6O95503 412 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TSPAN13O95857 204 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FTLP02792 175 aaPredicted RBP-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CHRM4P08173 479 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FAM153BP0C7A2 387 aa-2.46□□□□□ -2.8
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC166P0CW27 439 aa-2.46□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms