RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 SLC26A5P58743 744 aa22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 IRF8Q02556 426 aa22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ACER2Q5QJU3 275 aa22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 CRLF3Q8IUI8 442 aa22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 BEST3Q8N1M1 668 aa22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 CA13Q8N1Q1 262 aa22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 EXT2Q93063 718 aa22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 MTBPQ96DY7 904 aa22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 PTCHD1Q96NR3 888 aa22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 GPR78Q96P69 363 aa22.07■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 A0A0G2JN53 185 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 PRMT3O60678 531 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 RNH1P13489 461 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 EPB42P16452 691 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 PIK3CGP48736 1102 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ST13P50502 369 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 IRF9Q00978 393 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 DOC2AQ14183 400 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 SETDB1Q15047 1291 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 INAQ16352 499 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ADPRMQ3LIE5 342 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 QSOX2Q6ZRP7 698 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 LCA5Q86VQ0 697 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 CCT6BQ92526 530 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 FAR2Q96K12 515 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 C5orf34Q96MH7 638 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 VPS11Q9H270 941 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ADGRE2Q9UHX3 823 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 OSGIN2Q9Y236 505 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 LRIT2A6NDA9 550 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 RIPK2O43353 540 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 MAN1A2O60476 641 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 UGDHO60701 494 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 PRAMEF2O60811 474 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 GFAPP14136 432 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 MAOAP21397 527 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 TDGF1P3P51864 188 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 BTN3A2P78410 334 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 TGM3Q08188 693 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 CHIT1Q13231 466 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 VN1R5Q7Z5H4 357 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 CYP4X1Q8N118 509 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 SUN3Q8TAQ9 357 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 NR4A3Q92570 626 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 MS4A6EQ96DS6 147 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 RUNX2Q13950 521 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.04■■□□□ 1.122e-9■■■■■ 45
FAAP20-201ENST00000378543 MEP1AQ16819 746 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ADNP2Q6IQ32 1131 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 TIFABQ6ZNK6 161 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 KIF2BQ8N4N8 673 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC77Q9BR77 488 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 TXLNGYQ9BZA5 131 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ROGDIQ9GZN7 287 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 NECTIN3Q9NQS3 549 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 PRDM9Q9NQV7 894 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ASB1Q9Y576 335 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ERI3O43414 337 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 RASAL1O95294 804 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 EPORP19235 508 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 CD22P20273 847 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 TUBA3CQ13748 450 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 PFKFB4Q16877 469 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 C4orf17Q53FE4 359 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 TECRLQ5HYJ1 363 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 TUBA3EQ6PEY2 450 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ADGRD1Q6QNK2 874 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 OR2L5Q8NG80 312 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ELP5Q8TE02 316 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 ANKRD10Q9NXR5 420 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 TRIM49D1C9J1S8 452 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 MYBL2P10244 700 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 TNFRSF8P28908 595 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 CD96P40200 585 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 RCN2Q14257 317 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-201ENST00000378543 TMEM35AQ53FP2 167 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.3 ms