RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366391.6

SH3BP5-201, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP5, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-201ENST00000366391 UGDHO60701 494 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 SMIM24O75264 130 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 TGFB1P01137 390 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 MAOAP21397 527 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 SERPINB1P30740 379 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 RAB38P57729 211 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 EXT1Q16394 746 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 UBE3DQ7Z6J8 389 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 M1APQ8TC57 530 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 CMTM7Q96FZ5 175 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 CNDP1Q96KN2 507 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNC2Q96PR1 638 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 PRM3Q9NNZ6 103 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 NECTIN3Q9NQS3 549 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 ADGRE2Q9UHX3 823 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 MMACHCQ9Y4U1 282 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa17.35■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 SH3BGRLO75368 114 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 SBK3P0C264 359 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 TNFRSF8P28908 595 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 SLC26A5P58743 744 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM35AQ53FP2 167 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF793Q6ZN11 406 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 CHSY3Q70JA7 882 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 CYP4X1Q8N118 509 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 RNF175Q8N4F7 328 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 GALNT11Q8NCW6 608 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 HUS1BQ8NHY5 278 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 TBCDQ9BTW9 1192 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 KCNK13Q9HB14 408 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 PLA2G3Q9NZ20 509 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 MAP10Q9P2G4 905 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 DAPP1Q9UN19 280 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa17.34■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 PTPN13Q12923 2485 aa17.33■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
SH3BP5-201ENST00000366391 DYTNA2CJ06 578 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 H0YIV9 168 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 RTCAO00442 366 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 OR7A17O14581 309 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 VPS4BO75351 444 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 PIK3CBP42338 1070 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 LIM2P55344 173 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ARG2P78540 354 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 TLR1Q15399 786 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 DEPDC1Q5TB30 811 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ABHD17BQ5VST6 288 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 H3F3CQ6NXT2 135 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 SCUBE1Q8IWY4 988 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM151AQ8N4L1 468 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 L3MBTL4Q8NA19 623 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 TMEM52Q8NDY8 209 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CATSPER1Q8NEC5 780 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ARMC2Q8NEN0 867 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 HAS2Q92819 552 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 C19orf60Q96EN9 201 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CCDC77Q9BR77 488 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ROGDIQ9GZN7 287 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 OR51B5Q9H339 312 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ZBTB26Q9HCK0 441 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 MMP25Q9NPA2 562 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 DMRT3Q9NQL9 472 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ASF1BQ9NVP2 202 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 PCTPQ9UKL6 214 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 VPS4AQ9UN37 437 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 RNF11Q9Y3C5 154 aa17.33■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 POLEQ07864 2286 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 A8MUI8 341 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CLDN4O14493 209 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 SCELO95171 688 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 CLDN9O95484 217 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 TSFMP43897 325 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 HSD17B7P56937 341 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF33BQ06732 778 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 AP5B1Q2VPB7 878 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ZNF595Q8IYB9 648 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 ACOT4Q8N9L9 421 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 FAM47BQ8NA70 645 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 OR52B6Q8NGF0 335 aa17.32■□□□□ 0.36
SH3BP5-201ENST00000366391 MZB1Q8WU39 189 aa17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms