RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRDM9Q9NQV7 894 aa18.36■□□□□ 0.53
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRDM7Q9NQW5 492 aa18.36■□□□□ 0.53
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PTPRCAP-201ENST00000326294 PCTPQ9UKL6 214 aa18.36■□□□□ 0.53
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PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
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PTPRCAP-201ENST00000326294 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
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PTPRCAP-201ENST00000326294 SAGE2PA6NJ88 616 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA8RI6L899 631 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLDN9O95484 217 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDPCPO95876 746 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 F10P00742 488 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
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PTPRCAP-201ENST00000326294 UQCRFS1P47985 274 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSD17B7P56937 341 aa18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPS13P62277 151 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF33BQ06732 778 aa18.32■□□□□ 0.52
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