RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299240.10

TTC17-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 17, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC17, Length 3,648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17-202ENST00000299240 CCT8P50990 548 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 RCBTB1Q8NDN9 531 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 MAP3K3Q99759 626 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 VCXQ9H320 206 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 EPHX3Q9H6B9 360 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 CD300AQ9UGN4 299 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 M0QX08 132 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 FRS3O43559 492 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 UGT2B7P16662 529 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 CDK9P50750 372 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 HOXC5Q00444 222 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 AGERQ15109 404 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 DUOXA1Q1HG43 343 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 FIGLAQ6QHK4 219 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 ZNF793Q6ZN11 406 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 FBXL20Q96IG2 436 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 LRRC61Q9BV99 259 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 REEP4Q9H6H4 257 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 KLHL42Q9P2K6 505 aa12.01□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 CREG1O75629 220 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 LDLRP01130 860 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 BCHEP06276 602 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 ST6GAL1P15907 406 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 CXCR2P25025 360 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 LSSP48449 732 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 CDH15P55291 814 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 MINDY4Q4G0A6 757 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 C1orf189Q5VU69 101 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 USP30Q70CQ3 517 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 CEP68Q76N32 757 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 ZNF786Q8N393 782 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 ACOT4Q8N9L9 421 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 SLC47A1Q96FL8 570 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 CCT7Q99832 543 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 GSDMCQ9BYG8 508 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 A0A1W2PPC4 97 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 ATP4BP51164 291 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 NKG7Q16617 165 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 SPIN4Q56A73 249 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 SYT13Q7L8C5 426 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 DNASE1L2Q92874 299 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 RGMAQ96B86 450 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 ADNPQ9H2P0 1102 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 FAM60AQ9NP50 221 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 SLAMF7Q9NQ25 335 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 CCDC88CQ9P219 2028 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 HELZP42694 1942 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 RHPN2P1A8MT19 583 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 I3L1I5 382 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 PLOD2O00469 737 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 SLC22A2O15244 555 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 PGDP52209 483 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 RPA4Q13156 261 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 HMBOX1Q6NT76 420 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 CEACAM20Q6UY09 585 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 NUDT13Q86X67 352 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 UBE2E3Q969T4 207 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 TIMM29Q9BSF4 260 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 SLC52A3Q9NQ40 469 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 SERHLQ9NQF3 203 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 ANKMY1Q9P2S6 941 aa12□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 P2RX6O15547 441 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 FAM58BPP0C7Q3 252 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 RABIFP47224 123 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 SHC2P98077 582 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 PRKCQQ04759 706 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 KLC1Q07866 573 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 PRMT9Q6P2P2 845 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 NRROSQ86YC3 692 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 MICU2Q8IYU8 434 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 OR9A4Q8NGU2 314 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 CHTF18Q8WVB6 975 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 SDCCAG3Q96C92 435 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 C16orf58Q96GQ5 468 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 DUSP12Q9UNI6 340 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 MAN1A2O60476 641 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 SLC35G6P0C7Q6 338 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 CPN2P22792 545 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 FOXM1Q08050 763 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 GPR19Q15760 415 aa11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
TTC17-202ENST00000299240 GPAT3Q53EU6 434 aa11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms