RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 THSD1Q9NS62 852 aa16.57■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 WDR70Q9NW82 654 aa16.57■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 MKLN1Q9UL63 735 aa16.57■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.57■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 NOX1Q9Y5S8 564 aa16.57■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 SCN5AQ14524 2016 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 DOCK6Q96HP0 2047 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 WWP2O00308 870 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 CCRL2O00421 344 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 CCNB2O95067 398 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 TGFB1P01137 390 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 PCSK2P16519 638 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 SOAT1P35610 550 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 RPS19P39019 145 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 LIMS1P48059 325 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 OR2B6P58173 313 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 DEFA1P59665 94 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 DEFA3P59666 94 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 CDC42P60953 191 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 POM121L1PQ3SYA9 428 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 SYTL3Q4VX76 610 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 C19orf48Q6RUI8 117 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 GAREM2Q75VX8 874 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 NLRP8Q86W28 1048 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 OR52N2Q8NGI0 321 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 CRELD1Q96HD1 420 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 OR2A14Q96R47 310 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 OR51B5Q9H339 312 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 REEP4Q9H6H4 257 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 HHATLQ9HCP6 504 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 MUTYHQ9UIF7 546 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 ENTPD6O75354 484 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 OLFM2O95897 454 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 GABRR2P28476 465 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 ETV6P41212 452 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 RPS26P62854 115 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 SPIN4Q56A73 249 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 GPR151Q8TDV0 419 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 TAPBPLQ9BX59 468 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 CFL2Q9Y281 166 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 INSL5Q9Y5Q6 135 aa16.56■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 TRBC2A0A5B9 178 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 PLK4O00444 970 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 FFAR1O14842 300 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 NPC1O15118 1278 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 GJA8P48165 433 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF763Q0D2J5 394 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 ATAD3CQ5T2N8 411 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 PLAG1Q6DJT9 500 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 OR6F1Q8NGZ6 308 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 YME1L1Q96TA2 773 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 FAM83DQ9H4H8 585 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 SMURF1Q9HCE7 757 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 ZAR1LA6NP61 321 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 KLHL18O94889 574 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 APOA1P02647 267 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 LIM2P55344 173 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 KCNC3Q14003 757 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 STARD3Q14849 445 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP16.55■□□□□ 0.247e-7■■■■□ 25.5
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PDE4A-201ENST00000293683 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM159Q96B96 161 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 SPNS1Q9H2V7 528 aa16.55■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa16.54■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 EFCAB10A6NFE3 127 aa16.54■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 PDZK1P1A8MUH7 402 aa16.54■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 FURINP09958 794 aa16.54■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 HSD3B1P14060 373 aa16.54■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 HSD3B2P26439 372 aa16.54■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 HTR3AP46098 478 aa16.54■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 CRISP1P54107 249 aa16.54■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF33BQ06732 778 aa16.54■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 FCHO2Q0JRZ9 810 aa16.54■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP16.54■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 MPPE1Q53F39 396 aa16.54■□□□□ 0.24
PDE4A-201ENST00000293683 FRMPD2BQ6IN97 320 aa16.54■□□□□ 0.24
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