RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290317.9

SLC13A3-202, Transcript of solute carrier family 13 member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC13A3, Length 3,994 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3-202ENST00000290317 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 GABRG2P18507 467 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 COL9A1P20849 921 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 PIK3R1P27986 724 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 NFATC4Q14934 902 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 SBSNQ6UWP8 590 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 CEP68Q76N32 757 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 TBC1D21Q8IYX1 336 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 LHFPL5Q8TAF8 219 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 RLN3Q8WXF3 142 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC22A18Q96BI1 424 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 RTKNQ9BST9 563 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 LRTM1Q9HBL6 345 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 SPASTQ9UBP0 616 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 AURKCQ9UQB9 309 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 PTPRSQ13332 1948 aa7.4□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 CCDC182A6NF36 153 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 OR5K4A6NMS3 321 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 THEGLP0DJG4 465 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 ICAM2P13598 275 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 MTHFD2P13995 350 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 AMD1P17707 334 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 PDHA2P29803 388 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 LSM3P62310 102 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 AGAP6Q5VW22 663 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 LIPJQ5W064 366 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 DESI1Q6ICB0 168 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 TMEM92Q6UXU6 159 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 PDZD3Q86UT5 571 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 STX12Q86Y82 276 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 SPEM1Q8N4L4 309 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 CAMKK1Q8N5S9 505 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 DEFB119Q8N690 84 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 AVL9Q8NBF6 648 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 MARK4Q96L34 752 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 ZNF597Q96LX8 424 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 AGAP4Q96P64 663 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 QRFPRQ96P65 431 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 OR52B2Q96RD2 323 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 ADI1Q9BV57 179 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 TRPS1Q9UHF7 1281 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 A0A1W2PQF6 199 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC5A10A0PJK1 596 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 CCDC154A6NI56 674 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 PRSS44E7EML9 344 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 SHOXO15266 292 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 LAMTOR5O43504 91 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 DNAJB5O75953 348 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 PDGFAP04085 211 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 RPL38P63173 70 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 IL1RL1Q01638 556 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 Q6ZS52 159 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 SYVN1Q86TM6 617 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 STK32CQ86UX6 486 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 TRIM69Q86WT6 500 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 BTBD2Q9BX70 525 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 TEX101Q9BY14 249 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 FOXQ1Q9C009 403 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 SRMSQ9H3Y6 488 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 BAG5Q9UL15 447 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 INVSQ9Y283 1065 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 NOTCH4Q99466 2003 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 PRSS38A1L453 326 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 TNFRSF21O75509 655 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 TSPAN12O95859 305 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 SLC16A8O95907 504 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 SBK3P0C264 359 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 CKMT2P17540 419 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 CMPK1P30085 196 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 YAP1P46937 504 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 ARL4DP49703 201 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 CCR5P51681 352 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 CCINQ13939 588 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 TMEM31Q5JXX7 168 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 FRG2Q64ET8 278 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 LAYNQ6UX15 382 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 GJD3Q8N144 294 aa7.39□□□□□ -1.23
SLC13A3-202ENST00000290317 LILRA2Q8N149 483 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms