RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TBC1D3BA6NDS4 549 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 A8MVJ9 347 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FGF18O76093 207 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLITRK5O94991 958 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 RAB36O95755 333 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 BCHEP06276 602 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CTSAP10619 480 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TNNI3P19429 210 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CD247P20963 164 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 IL12RB1P42701 662 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NCS1P62166 190 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PRKCDQ05655 676 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 HSPB3Q12988 150 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LCN1P1Q5VSP4 162 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LACC1Q8IV20 430 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CHPFQ8IZ52 775 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 FAM86B1Q8N7N1 296 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OR56A1Q8NGH5 318 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TRIM64A6NGJ6 449 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 AGAP5A6NIR3 686 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NPIPB8E9PQR5 432 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MFN2O95140 757 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 IL3P08700 152 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLC15A1P46059 708 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TLE2Q04725 743 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PLPP4Q5VZY2 271 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ZNF765Q7L2R6 523 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 COMMD6Q7Z4G1 85 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLC22A15Q8IZD6 547 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CPA6Q8N4T0 437 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OR4K1Q8NGD4 311 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OR56A3Q8NH54 315 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ZFP90Q8TF47 636 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 RAB7BQ96AH8 199 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 KCNS3Q9BQ31 491 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLC22A4Q9H015 551 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ACTL8Q9H568 366 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TRIM39Q9HCM9 518 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PPT2Q9UMR5 302 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PPIL1Q9Y3C6 166 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 MYO16Q9Y6X6 1858 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OR1F1O43749 312 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SEMA3DO95025 777 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CLTBP09497 229 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CMPK1P30085 196 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PRKAG1P54619 331 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OR2B6P58173 313 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TEAD2Q15562 447 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ZNF697Q5TEC3 545 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ZNF730Q6ZMV8 503 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 KCTD7Q96MP8 289 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TMEM38AQ9H6F2 299 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PRR23AA6NEV1 266 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 H0Y858 1186 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SAP18O00422 153 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TGM5O43548 720 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 IDSP22304 550 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TACR1P25103 407 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 NUDT6P53370 316 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PFN3P60673 137 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLC35A2P78381 396 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SLC9A5Q14940 896 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 LY6G5CQ5SRR4 150 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CHTF18Q8WVB6 975 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 YIPF6Q96EC8 236 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 PITX2Q99697 317 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 ANKRA2Q9H9E1 313 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 TAS2R7Q9NYW3 318 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 CMAHPQ9Y471 501 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OR2A25A4D2G3 310 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 WASH3PC4AMC7 463 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 SULT1C4O75897 302 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 OSMP13725 252 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DRD2P14416 443 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GADD45AP24522 165 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 EMP3P54852 163 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 COX10Q12887 443 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 DNASE1L3Q13609 305 aa8.48□□□□□ -1.05
HERC3-201ENST00000264345 KIAA0040Q15053 153 aa8.48□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms