RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 IFI30P13284 250 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CD9P21926 228 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 HLA-FP30511 346 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CCR7P32248 378 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SOX2P48431 317 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SOX9P48436 509 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CLK3P49761 638 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 KHKP50053 298 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CLCN7P51798 805 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CDH11P55287 796 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 GSCP56915 257 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CLDN2P57739 230 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 RPL26P61254 145 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 HOXC5Q00444 222 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 RAB33AQ14088 237 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 NADSYN1Q6IA69 706 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 REEP3Q6NUK4 255 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 TRIM73Q86UV7 250 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 RETREG3Q86VR2 466 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ZFAND4Q86XD8 727 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SNX29P2Q8IUI4 249 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 PGBD5Q8N414 524 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 RASSF5Q8WWW0 418 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 KLHL6Q8WZ60 621 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 P2RY13Q9BPV8 354 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CYP8B1Q9UNU6 501 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 OARD1Q9Y530 152 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 NME7Q9Y5B8 376 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 USP3Q9Y6I4 520 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 C4BP0C0L5 1744 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 MAGEB3O15480 346 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SDC3O75056 442 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 DHFRP00374 187 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 C8BP07358 591 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 GIMD1P0DJR0 217 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 AGXTP21549 392 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 NCS1P62166 190 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ADAM17P78536 824 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 VLDLRP98155 873 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SCN1BQ07699 218 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CD47Q08722 323 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 UGT8Q16880 541 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 LIPKQ5VXJ0 399 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CES4AQ5XG92 561 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 OLFML2AQ68BL7 652 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 TMEM107Q6UX40 140 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 COMMD6Q7Z4G1 85 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 C6orf120Q7Z4R8 191 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SLC22A16Q86VW1 577 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 LMX1AQ8TE12 382 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 RLN3Q8WXF3 142 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ZUFSPQ96AP4 578 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 GSDMCQ9BYG8 508 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 KCNH6Q9H252 994 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 EURLQ9NYK6 297 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CCL26Q9Y258 94 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 GPR52Q9Y2T5 361 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 LOC100509620A0A075B734 347 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 UNCXA6NJT0 531 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 HIDE1A8MVS5 230 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CAPN14A8MX76 684 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 TMEM150CB9EJG8 249 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 RFXAPO00287 272 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 PRMT3O60678 531 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 ABCB7O75027 752 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 PRAMEF12O95522 483 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 GNRH1P01148 92 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CBSLP0DN79 551 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 IL12BP29460 328 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CBSP35520 551 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 CD83Q01151 205 aa5.3□□□□□ -1.56
LMO3-201ENST00000261169 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms