RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Agbl5Q09M02 886 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 GmncQ3URY2 333 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Map3k7Q62073 579 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dag1Q62165 893 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Psd2Q6P1I6 770 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Txndc15Q6P6J9 344 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ckmt2Q6P8J7 419 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dennd2cQ6P9P8 914 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abhd16bQ80YU0 474 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atl1Q8BH66 558 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Stk-ps2Q8C0V7 499 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Abhd18Q8C1A9 464 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Piwil4Q8CGT6 848 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 BtdQ8CIF4 520 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc35c2Q8VCX2 364 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Chrdl2Q8VEA6 426 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 HnrnprQ8VHM5 632 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cttnbp2nlQ99LJ0 638 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ndufaf1Q9CWX2 328 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cdrt4Q9DA64 179 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slco1c1Q9ERB5 715 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Adam18Q9R157 719 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Igkv15-103A0A140T8P3 115 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zfp300A2AE21 645 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr220E9Q050 325 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ceacam3E9Q6J4 706 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 GnazO70443 355 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Htr5bP31387 370 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Impdh1P50096 514 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nanos3P60324 178 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sec31bQ3TZ89 1158 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rars2Q3U186 578 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q5SPV6 233 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gpr75Q6X632 540 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Plekha8Q80W71 519 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Snx32Q80ZJ7 404 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Adam32Q8K410 754 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Utp6Q8VCY6 597 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam173bQ9D1Z3 247 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfr701Q9D3U9 316 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Clca3a2Q9EQR4 902 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cdh22Q9WTP5 813 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 FarsbQ9WUA2 589 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cped1B2RX70 1026 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf382B2RXC5 579 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 E2f3O35261 457 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Folh1O35409 752 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tm9sf2P58021 662 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 OstnP61364 130 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc6a3Q61327 619 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Itih3Q61704 889 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Il1rapQ61730 570 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Six3Q62233 333 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tle1Q62440 770 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PnocQ64387 187 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Msrb2Q78J03 175 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rslcan18Q7M6X5 460 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AftphQ80WT5 931 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tm9sf4Q8BH24 643 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ints9Q8K114 658 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm16286Q9CQX6 220 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tex19.2Q9D5S1 317 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc182Q9D9C6 152 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pop7Q9DCH2 140 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mpp2Q9WV34 552 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ehd1Q9WVK4 534 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cacna1cQ01815 2139 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Qrich2A0A140LIY9 2337 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Spats1A2RRY8 269 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Spata31d1cE9QAF1 853 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vmn2r38G3UYA8 861 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vmn2r31L7N1Z4 861 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Vmn2r44L7N2E1 861 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 VaspP70460 375 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem120bQ3TA38 339 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ankmy2Q3TPE9 440 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Scn2bQ56A07 215 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Xrcc1Q60596 631 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sdc3Q64519 442 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nadsyn1Q711T7 725 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prkaa2Q8BRK8 552 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nudt13Q8JZU0 352 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Exd2Q8VEG4 650 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Golga7Q91W53 137 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Crtc3Q91X84 619 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Txndc9Q9CQ79 226 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nudt14Q9D142 222 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ebna1bp2Q9D903 306 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 RgccQ9DBX1 137 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Myg1Q9JK81 380 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm3752A6NAT4 150 aa20.45■□□□□ 0.86
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc9a5B2RXE2 898 aa20.45■□□□□ 0.86
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm17067E9Q6S4 354 aa20.45■□□□□ 0.86
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm10340K7N708 205 aa20.45■□□□□ 0.86
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 HgdO09173 445 aa20.45■□□□□ 0.86
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Angpt2O35608 496 aa20.45■□□□□ 0.86
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Il9P15247 144 aa20.45■□□□□ 0.86
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ces1cP23953 554 aa20.45■□□□□ 0.86
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Btbd3P58545 530 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.1 ms