RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640577.1

SPIN3-242, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,436 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-242ENST00000640577 TMPRSS11DO60235 418 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 TNFRSF21O75509 655 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 SHMT2P34897 504 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 CRATP43155 626 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 ERICH5Q6P6B1 374 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 CBLL1Q75N03 491 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 ADCK2Q7Z695 626 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 EID3Q8N140 333 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 FBXL6Q8N531 539 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 BMFQ96LC9 184 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 PCBD2Q9H0N5 130 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 RMI1Q9H9A7 625 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 SLC6A20Q9NP91 592 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 THEGQ9P2T0 379 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 SNX11Q9Y5W9 270 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 MTCH2Q9Y6C9 303 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 MYO15AQ9UKN7 3530 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 CCDC160A6NGH7 325 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 C4orf51C9J302 202 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 LSAMPQ13449 338 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 VEZF1Q14119 521 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 IQCCQ4KMZ1 466 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 RD3Q7Z3Z2 195 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 KCNK12Q9HB15 430 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 ATAD3AQ9NVI7 634 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 CD207Q9UJ71 328 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 SCN3AQ9NY46 2000 aa14.66□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 WASHC1A8K0Z3 465 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 ALBP02768 609 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 TPMTP51580 245 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 MAPK12P53778 367 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 WASH2PQ6VEQ5 465 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 RNF130Q86XS8 419 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 TDHQ8IZJ6 230 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 OR2L8Q8NGY9 312 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 KLHL31Q9H511 634 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 TAS2R9Q9NYW1 312 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 A0A1W2PRB8 838 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 B4GAT1O43505 415 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 E2F6O75461 281 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 SEMA3DO95025 777 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 SERPIND1P05546 499 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 ASGR2P07307 311 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 CXCR2P25025 360 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 BCL6P41182 706 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 NR1H2P55055 460 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 KRT33BQ14525 404 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 SVOPLQ8N434 492 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 PJA1Q8NG27 643 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 OR5K1Q8NHB7 308 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 TPD52L3Q96J77 140 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 CXorf36Q9H7Y0 433 aa14.65□□□□□ -0.06
SPIN3-242ENST00000640577 H0YAE9 185 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 NDUFS4O43181 175 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 MITFO75030 526 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 HPRP00739 348 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 OPN1SWP03999 348 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 DDCP20711 480 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 DRD1P21728 446 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 ELK4P28324 431 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 ALDH9A1P49189 494 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 PLA2G16P53816 162 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 CTBSQ01459 385 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 USP30Q70CQ3 517 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 IKBIPQ70UQ0 350 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 MTERF3Q96E29 417 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 C7orf34Q96L11 122 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 SH3GL3Q99963 347 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 FBRSQ9HAH7 460 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 VCX3AQ9NNX9 186 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 C1GALT1Q9NS00 363 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-242ENST00000640577 FAM118AQ9NWS6 357 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms